国家自然科学基金(31070332) 作品数:9 被引量:14 H指数:2 相关作者: 徐来祥 薛慧良 徐金会 陈蕾 卜凡莉 更多>> 相关机构: 曲阜师范大学 中国科学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 山东省高等学校科技计划项目 山东省自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 理学 更多>>
黑线仓鼠KiSS-1基因的生物信息学与系统进化研究 被引量:2 2012年 采用RT-PCR技术克隆得到黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)KiSS-1基因的部分序列,并进行生物信息学分析。结果表明:该段序列共429bp,包含部分5'非翻译区、转录起始位点、信号肽序列以及主要的活性区域。黑线仓鼠KiSS-1编码的蛋白质是一种胞外分泌的亲水性蛋白质,N端含有19个氨基酸组成的信号肽序列,67、121-122位各有一个水解位点,68、69处的磷酸化位点可能与蛋白质活性的获得有关。二级结构预测含有较多的α螺旋和自由卷曲,115-119位的α螺旋在与受体结合中有重要作用。系统进化分析证实该序列与其他物种有较高的同源性,说明该基因在进化中相对保守。通过生物信息学与系统进化分析,有助于进一步揭示KiSS-1的转运加工途径及作用机制。 张强 卜凡莉 徐金会 薛慧良 杨月伟 徐来祥关键词:黑线仓鼠 KISS-1 生物信息学 系统进化分析 GnRH在黑线仓鼠不同器官中的差异表达 2013年 该研究以野生黑线仓鼠为材料,用实时定量PCR方法检测GnRH在下丘脑和部分生殖器官(睾丸、附睾、储精囊、卵巢、子宫)中的表达量,并分析个体间的表达差异.研究结果表明:①GnRH在黑线仓鼠的下丘脑、睾丸、附睾、储精囊、卵巢、子宫中均有表达,其中在下丘脑中的表达量相对较高而在生殖器官则表达量较低;②在雄性个体中,GnRH在下丘脑、睾丸、附睾、储精囊四种组织中表达量的比值为1∶0.166∶0.189∶0.073;③在雌性个体中,GnRH在下丘脑、卵巢.子宫三种组织中表达量的比值为1∶0.304∶0.040.研究结果显示,GnRH在不同组织和不同个体间均存在差异性表达,提示GnRH既可以通过下丘脑直接影响生殖功能,又可以直接参与生殖系统功能的调控,但其调控机制可能有所不同.研究结果将为研究GnRH在黑线仓鼠的功能及分子调控机制奠定基础,为探究野生黑线仓鼠繁殖动态的遗传调控机制提供理论保障,并为农田鼠害的综合防治提供科学依据. 王硕 徐晓飞 徐金会 薛慧良 张璇 徐来祥关键词:GNRH 黑线仓鼠 实时荧光定量PCR 分子机制 黑线仓鼠PPARβ部分编码区克隆与结构特征 2012年 参考黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)近缘种PPARβ的cDNA序列设计引物,采用RT-PCR法克隆得到黑线仓鼠PPARβ部分序列,并翻译成氨基酸.利用该结果与其他物种核苷酸及氨基酸序列进行相似性比较、构建系统进化树、一级结构分析、二级结构和空间结构预测.结果表明:得到的480 bp PPARβ序列包括部分外显子4,全部外显子5、6及部分外显子7;共编码159个氨基酸;除人之外,黑线仓鼠PPARβ基因与其他物种的核苷酸相似性均在88%-94%之间,氨基酸相似性均在90%以上;构建进化树得出,黑线仓鼠与鼠类亲缘关系最近,与人的亲缘关系最远;疏水性分析、二级结构预显示该编码区亲水性较强;二级结构、空间结构预测显示该序列含α螺旋较多;空间结构预测看出该段区域含两个典型的锌指结构. 郑莹莹 徐来祥 徐金会 薛慧良 陈蕾关键词:黑线仓鼠 克隆 系统进化 空间结构 锌指结构 黑线仓鼠LHR部分序列的克隆与分析 被引量:2 2011年 以大鼠、小鼠、金仓鼠(Mesocricetus auratus)的同源保守序列设计了黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)黄体生成素受体基因(LHR)的引物,经PCR扩增得到了154 bp的目的产物,通过Blast证实该片段是黑线仓鼠的LHR序列.该段序列处于第11外显子的5’端,编码51个氨基酸,包含部分铰链区和第一个跨膜α螺旋(TM1)区.疏水性氨基酸所占比例相当高,其中缬氨酸、异亮氨酸各占9.80%,亮氨酸为19.61%,通过疏水性分析,TM1区具有典型的α螺旋特征.与大鼠、小鼠、金仓鼠等物种同源比对,核苷酸和氨基酸的同源性分别达到了83%-98%,82%-100%.α螺旋跨膜区的氨基酸同源性超过82%具有很强的保守性,但在26,41,44,48位点上仍然表现出种属之间的差异性.该研究用PCR的方法克隆出了黑线仓鼠LHR的部分序列,并对其进行了同源性分析,为今后黑线仓鼠种群繁殖机制、种群扩散模式等的研究奠定一定理论基础. 谢海燕 薛慧良 徐金会 王哲 徐来祥关键词:黑线仓鼠 克隆分析 黑线姬鼠OPN部分编码区结构与分子系统进化分析 被引量:1 2011年 以近缘种OPN的cDNA序列为参考设计引物,通过RT-PCR得到黑线姬鼠OPN部分序列,并将得到的cDNA序列翻译成氨基酸序列,注册到GenBank(登陆号:HM626723).利用该序列构建系统进化树,同时对其编码的蛋白质进行一级结构分析及二级结构预测.结果表明:克隆得到的209 bp OPN的序列,包括部分外显子4,全部的外显子5及部分外显子6;该段序列从第二个碱基开始翻译,共编码69个氨基酸;其一级结构中包括了一个由10个连续天冬氨酸组成的高度酸性区域,它对骨桥蛋白与羟基磷灰石之间的联系具有重要意义;二级结构中大部分为α螺旋,且具有亲水性;利用所得OPN序列构建的系统进化树显示黑线姬鼠与大鼠、小鼠亲缘关系最近,与鸡、鹌鹑亲缘关系最远,此结果与物种的进化关系相一致,本研究所得到的OPN序列将有助于对骨桥蛋白的作用机制研究及系统进行分析. 赵文捷 徐来祥 薛慧良关键词:黑线姬鼠 OPN 系统进化 黑线仓鼠CRH基因的编码序列及系统进化分析 被引量:3 2012年 为探究黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)繁殖功能与促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)基因结构的关系,参考近缘种的cDNA序列设计引物,采用RT-PCR法克隆得到了黑线仓鼠CRH基因的部分序列,克隆得到长度为1 112 bp,为外显子1和外显子2的部分序列,包括全部编码区序列564 bp;编码区共编码187个氨基酸,GenBank登录号为JQ416143。利用编码区序列构建系统进化树,结果显示,黑线仓鼠与大鼠、小鼠亲缘关系最近,与其他哺乳动物亲缘关系较近,而与原鸡亲缘关系最远,此结果与物种的进化关系相一致。同时对其编码的蛋白质进行一级结构分析及二级、三级结构预测,得到了CRH的信号肽序列和41个氨基酸组成。本研究首次报道了黑线仓鼠的CRH基因序列,为进一步探究CRH基因奠定基础,对系统分析CRH的功能具有重要的参考价值,同时该cDNA序列可作为物种亲缘关系或遗传距离研究的理想标记。 张琪 薛慧良 徐金会 陈蕾 徐来祥关键词:黑线仓鼠 系统进化 RFRP-3/GPR147在黑线仓鼠下丘脑的差异表达 动物体为了获得最大的繁殖成功率,保证母体和后代最大的存活率,只在一年中最适宜的某个时间段进行繁殖,这种现象被称为季节性繁殖。季节性繁殖活动是调控动物种群数量季节性波动的一个主要因素。黑线仓鼠(Cricetulus bar... 刘菲 薛慧良 徐金会 陈蕾 徐来祥禁食时间对雌性长爪沙鼠免疫功能的影响 被引量:6 2015年 动物的免疫系统是防御细菌、病毒等病原体侵害的重要途径,对其生存至关重要,而食物短缺是影响动物免疫的重要因素。前期研究发现,禁食3 d可抑制雌性长爪沙鼠T细胞介导的免疫功能,而禁食时长可能在影响动物免疫中起重要作用。为此,本实验主要测定不同的禁食时间如何影响雌性长爪沙鼠的免疫功能,该问题的解决有助于了解它们在野外面临食物短缺时的生存状况。将55只成年雌鼠随机分为8组,分别禁食1 d、2 d、3 d和自由取食,每种处理分别注射磷酸缓冲液和植物血凝素(PHA)。结果发现,随禁食时间的延长,PHA反应(指示T细胞介导的免疫功能)逐渐受到抑制,胸腺和脾脏逐渐萎缩,表明禁食时间对长爪沙鼠的免疫功能影响显著。同样,随饥饿时间增加,长爪沙鼠的体脂、血糖和血清瘦素水平逐渐下降,并且与PHA反应呈正相关,但白细胞总数和皮质酮水平不受禁食时间的影响。结果表明,禁食时间长短能显著影响雌性长爪沙鼠的免疫功能,随禁食时间的延长,长爪沙鼠T细胞介导的免疫功能逐渐受抑制,这可能与体脂和葡萄糖含量下降有关,血清瘦素逐渐降低也可能是其免疫受抑制的原因。 徐德立 王德华关键词:长爪沙鼠 禁食 植物血凝素 瘦素 野生黑线仓鼠雌雄个体空间记忆能力比较研究 为了探讨黑线仓鼠空间记忆能力与时间的关系及性别差异,我们利用经典morris水迷宫实验对黑线仓鼠空间记忆能力进行了研究。实验分为空间学习记忆测定实验(定位航行实验)和空间记忆保持测定实验(探索实验),实验结果表明黑线仓鼠... 杨月伟 朱金昌 徐来祥关键词:黑线仓鼠 空间记忆 水迷宫实验 文献传递 正常状态下黑线仓鼠脑内c-fos的基础表达 2012年 目的:研究正常状态下黑线仓鼠脑内前脑皮层、海马和下丘脑区c-fos的基础表达。方法:采用免疫组织化学方法(SABC)检测c-fos蛋白在黑线仓前脑皮层、海马和下丘脑区的表达,以昆明品系小鼠为对照,建立足底电击急性应激小鼠模型。结果:正常生活状态下黑线仓鼠脑内前脑皮层、海马和下丘脑区c-fos蛋白广泛表达;其中海马CA1和CA3区c-fos阳性神经元相对数量较少,海马DG区、前脑皮层和下丘脑区c-fos阳性神经元相对数量较多;与正常小鼠相比,前脑皮层c-fos阳性神经元显著增多(P<0.01)。应激小鼠各脑区c-fos阳性神经元数量明显增多,与正常小鼠比较有统计学显著差异(P<0.05,P<0.01)。各脑区c-fos阳性神经元平均目标灰度值结果类似。结论:正常状态下黑线仓鼠脑内c-fos蛋白的表达可能与动物的行为活动和内分泌、空间认知功能以及复杂运动的调控密切相关。 李广宇 宋倩 李亚 徐来祥关键词:黑线仓鼠 C-FOS 海马 下丘脑