国家科技支撑计划(2006BAD13B06-1-4)
- 作品数:2 被引量:39H指数:2
- 相关作者:江东王福生彭爱红叶庆亮更多>>
- 相关机构:中国农业科学院柑桔研究所西南大学更多>>
- 发文基金:重庆市自然科学基金国家科技支撑计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 应用cpSSR和EST-SSR标记进行柑橘特异种质资源遗传背景研究被引量:28
- 2010年
- 将叶绿体SSR和EST-SSR标记用于揭示柑橘及其近缘属的系统发育关系,并阐明保存在重庆国家果树种质柑橘圃内一些特异种质资源的遗传背景。其中50份材料和44份材料分别用cpSSR和EST-SSR分析。22对cpSSR引物产生146个多态性条带,平均检测到6.64个多态性条带,平均Shannon's多样性指数为0.32;18对EST-SSR引物产生240个多态性条带,平均检测到13.3个多态性条带,平均多态信息含量(PIC)为0.73,平均期望杂合度为0.78。根据cpSSR和EST-SSR分析,结合形态学证据,阐明一些特异柑橘种质资源的遗传背景,同时证明莽山野橘、元橘、宜昌橙有较近的亲缘关系。
- 王福生江东
- 关键词:柑橘CPSSREST-SSR
- ‘岩溪晚芦’椪柑果皮与果肉差减cDNA文库的构建及初步分析被引量:12
- 2009年
- 以‘岩溪晚芦’椪柑(Citrus reticulata Blanco)成熟果实果皮和果肉为材料,采用抑制性差减杂交技术成功构建了果皮(tester)与果肉(driver)的差减cDNA文库。结果显示:cDNA克隆外源插入片段大小介于100~500bp之间。成功对411个克隆进行了测序,测序结果经与NCBI基因库中序列进行比较,377个EST找到了同源序列,它们分属于126个基因,涉及到色素合成、能量代谢、初级代谢、次生代谢、抗逆防御、蛋白代谢、信号转导、香味形成、果皮软化(衰老)、精油合成、抗氧化等代谢途径和生理生化过程。还有一些基因涉及到三价铁螯合物、反转录转座子gag蛋白、查尔酮合成、硼离子转运、儿茶酚氧位甲基转移酶等功能。功能已知且没有重复的EST共有63个,占总数的49.2%。有5个基因共62个克隆虽在Blast搜索时找到了较高的同源性序列,但功能目前尚未明确。另有34个基因未搜索到同源序列,可能为新发现的基因。
- 叶庆亮江东彭爱红
- 关键词:CDNA文库表达序列标签差异表达基因