广西研究生教育创新计划(2009105981002D26)
- 作品数:2 被引量:4H指数:2
- 相关作者:王琪李力唐步坚唐兆前张玮更多>>
- 相关机构:广西医科大学附属肿瘤医院更多>>
- 发文基金:广西壮族自治区卫生厅重点科研课题广西研究生教育创新计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 卵巢癌卡铂耐药相关肿瘤抑制基因差异表达的研究被引量:2
- 2010年
- 目的分析卵巢癌卡铂耐药基因芯片中卡铂耐药细胞系SKOV3-CB较其亲本SKOV3细胞系差异表达下调的肿瘤抑制基因,并验证其差异表达。方法应用分子生物信息学方法 ,分析基因芯片中卵巢癌SKOV3-CB细胞系较SKOV3细胞系差异表达下调两倍以上的基因1554条,筛选出肿瘤抑制基因17个,即:RNASET2,VHL,DLG1,COPS2,NOL7,GGNBP2,RBL1,S100A2,PARG1,PERP,TCF3,DNAJA3,PCGF2,ING1,CYLD,RARRES3,RBBP8,应用荧光定量PCR技术对差异表达进行验证。结果 RNASET2,VHL,DLG1,COPS2,NOL7,RBL1,S100A2,PARG1,PERP,TCF3,DNAJA3,ING1,CYLD,RARRES3,RBBP8基因差异表达下调,下调倍数分别为24.47、65.24、10.81、21.30、72.94、5.95、27.13、1.57、1.32、12.93、46.80、7.57、14.90、14.00、23.98。GGNBP2,PCGF2,DLG1基因差异表达上调,上调倍数分别为5.76、2.19和17.10,基因芯片差异表达结果与real-timePCR所验证表达下降趋势的结果符合率为82.35%,下调两倍以上的基因符合率为64.70%。结论利用基因芯片技术分析基因差异表达,结合real-timePCR对其检测结果验证是一种有效的方法 ,多肿瘤抑制基因参与卵巢癌卡铂耐药的机制。
- 唐兆前李力张玮王琪唐步坚
- 关键词:卵巢肿瘤芯片分析技术
- 卵巢癌细胞卡铂耐药相关肿瘤抑制基因的表达变化及其启动子区甲基化观察被引量:2
- 2010年
- 目的观察卵巢癌卡铂耐药相关肿瘤抑制基因的表达变化及其启动子区甲基化状态。方法应用分子生物信息学方法,从卵巢癌卡铂耐药基因表达谱芯片中筛选13个肿瘤抑制基因(VHL、COPS2、NOL7、GGNBP2、RBL1、S100A2、PARG1、PERP、TCF3、DNAJA3、ING1、RARRES3、RBBP8),并采用RT-PCR法检测这些基因在卵巢癌卡铂耐药细胞系(SKOV3-CB)及其亲本细胞系(SKOV3)的表达;分析肿瘤抑制基因启动子区CPG岛并设计出8个基因(VHL、COPS2、NOL7、RBL1、PARG1、PERP、DNAJA3)的引物,采用甲基化特异性PCR法检测SKOV3-CB、SK-OV3细胞8个基因启动子区甲基化状态。结果与SKOV3相比,除GGNBP2基因外,其余12个基因均在SKOV3-CB中表达下调。SKOV3-CB、SKOV3的ING1、DNAJA3、VHL甲基化引物均能够扩增出产物,未甲基化引物均不能扩增出产物;COPS2、PERP甲基化引物均不能够扩增出产物,未甲基化引物均能够扩增出产物;PARG1、NOL7、RBL1甲基化引物与未甲基化引物均能够扩增出产物。结论卵巢癌卡铂耐药相关肿瘤抑制基因表达下调,其启动子区无甲基化;甲基化机制与卵巢癌卡铂耐药相关肿瘤抑制基因的表达下调无关。
- 唐兆前李力张玮王琪唐步坚
- 关键词:卡铂肿瘤耐药甲基化肿瘤抑制基因