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国家自然科学基金(60736028)

作品数:16 被引量:21H指数:3
相关作者:周天寿张家军苑占江何淼张淑波更多>>
相关机构:中山大学香港理工大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目国家教育部博士点基金更多>>
相关领域:生物学理学自动化与计算机技术医药卫生更多>>

文献类型

  • 16篇期刊文章
  • 2篇会议论文

领域

  • 12篇生物学
  • 4篇理学
  • 2篇自动化与计算...
  • 2篇医药卫生
  • 1篇机械工程
  • 1篇交通运输工程

主题

  • 7篇基因
  • 6篇噪声
  • 3篇信号
  • 3篇信号转导
  • 3篇转导
  • 3篇网络
  • 2篇蛋白
  • 2篇生化
  • 2篇细胞
  • 2篇基因状态
  • 1篇代谢途径
  • 1篇代谢网络
  • 1篇蛋白质
  • 1篇蛋白质类
  • 1篇蛋白质相互作...
  • 1篇凋亡
  • 1篇凋亡蛋白
  • 1篇多细胞
  • 1篇信号转导途径
  • 1篇信号转导网络

机构

  • 13篇中山大学
  • 2篇香港理工大学
  • 1篇河南大学

作者

  • 9篇周天寿
  • 6篇苑占江
  • 6篇张家军
  • 4篇何淼
  • 2篇陈维田
  • 2篇赵艳超
  • 2篇张淑波
  • 1篇张白冰
  • 1篇王军威
  • 1篇陈爱敏
  • 1篇陈爱敏
  • 1篇焦诗卉
  • 1篇刘箐
  • 1篇刘菁
  • 1篇李前
  • 1篇瞿俊雄
  • 1篇林强乾

传媒

  • 2篇江西师范大学...
  • 2篇中山大学学报...
  • 2篇Chines...
  • 2篇Acta M...
  • 2篇中华生物医学...
  • 1篇中国科学(C...
  • 1篇物理学报
  • 1篇中国科学(B...
  • 1篇生物化学与生...
  • 1篇力学季刊
  • 1篇生物物理学报
  • 1篇第五届全国复...

年份

  • 1篇2013
  • 2篇2012
  • 2篇2011
  • 4篇2010
  • 5篇2009
  • 3篇2008
  • 1篇2007
16 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
基因表达模型的研究进展:概率分布被引量:11
2012年
定量化基因表达(包括数学建模及定性与定量分析)是理解细胞内部过程的重要一步,也是当今系统生物学的核心研究内容.基因表达模型已从最初的单状态简单模型发展到考虑细化生物过程、众多生物因素的多状态复杂模型.基于生物学的中心法则,综述了有关基因表达模型的最新研究进展,聚焦于数学模型的完善、mRNA与蛋白质数目的概率分布等研究方面.通过综述,试图总结出有关基因表达的某些一般性规律,并提出今后需要进一步研究的问题与发展方向.
周天寿
关键词:基因状态概率密度母函数
基因调控系统中反馈压制的噪声:慢转录情形
2010年
对于基因调控系统,噪声与反馈之间的关系一直是令人关注的话题.本文以基本的正负反馈环路为模型,同时考虑了一个重要但被以往研究忽视的因素:非平衡基因状态波动或慢转录过程(如在真核细胞中),研究了反馈对噪声的效果,导出了修正的波动-耗散关系,显示出慢转录过程的速率对噪声与反馈之间的关系有重要影响.主要的定性影响包括:在无反馈情形,慢转录总是扩大内部噪声,但这种扩大效果随着慢转录过程速率的不断变大而逐渐消失,然而慢转录对外部噪声没有影响;相反地,负反馈在慢转录情形总是减低内部噪声,但减低的程度依赖于慢转录过程的速率,而正反馈在慢转录情形总是同时扩大内部噪声和减低外部噪声,但扩大或减低的程度依赖于慢转录过程的速率.此外,用Gillespie算法验证了理论预测.本研究为从生物物理学的角度理解噪声信号在自然网络中是如何传播的奠定了基础,也对理解细胞内部过程有指导意义.
苑占江张家军周天寿
关键词:噪声正反馈负反馈
First Passage Models for Denumerable Semi-Markov Decision Processes with Nonnegative Discounted Costs被引量:3
2011年
This paper considers a first passage model for discounted semi-Markov decision processes with denumerable states and nonnegative costs. The criterion to be optimized is the expected discounted cost incurred during a first passage time to a given target set. We first construct a semi-Markov decision process under a given semi-Markov decision kernel and a policy. Then, we prove that the value function satisfies the optimality equation and there exists an optimal (or ε-optimal) stationary policy under suitable conditions by using a minimum nonnegative solution approach. Further we give some properties of optimal policies. In addition, a value iteration algorithm for computing the value function and optimal policies is developed and an example is given. Finally, it is showed that our model is an extension of the first passage models for both discrete-time and continuous-time Markov decision processes.
Yong-hui Huang Xian-ping Guo
甲型流感病毒PB1-PA蛋白作用位点的发现与分析
2011年
基于共进化理论,探究了甲型流感病毒PB1蛋白与PA蛋白上具有共同进化可能性的保守九聚片段(C9MP)。结构信息显示PB1蛋白的第1-15位氨基酸与PA蛋白的第239-716位氨基酸具有相互作用域;对该区域变异分布的分析发现,PA蛋白第670位氨基酸Q所在的C9MP与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V和第13位氨基酸P所在的C9MP在PB1MP1相互作用面上具有最低的共进化值。结合DSSP程序的分析表明,由PA蛋白第670位氨基酸Q与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V与第13位氨基酸P构成的区域可能成为潜在的相互作用位点。
何淼林强乾赵艳超张淑波陈维田
关键词:甲型流感病毒相互作用位点
基因自调控环路的功能被引量:2
2010年
作为最简单且最典型的网络模块,基因自调控环路(其构成的反馈调控可以抑制或激活基因自身的表达)广泛存在于生物调控网络中,且是许多生物学功能的产生基础。虽然基因自调控环路很早以前便引起理论生物学家和实验生物学家的广泛关注,但随着对其生物学功能了解的日趋丰富,特别是当考虑细化的基因表达调控过程或更为真实的生物环境时,我们会发现其全新的生物学功能。揭示基因自调控环路的生物学功能是理解更复杂生物调控网络运行机制的基础,可对合成生物学的设计原理提供指导。文章综述了基因自调控模块的最新研究结果,特别讨论了其产生周期振动、双稳及其在信号处理等方面的潜能。
苑占江张家军周天寿
关键词:网络模块振动性
细胞内代谢途径中的噪声不传播
洗胞内代谢途径是高度关联的网络。由于生化反应中物种分子数的有限性使得这样一个网络必然涉及随机性,而这种随机性反过来会影响活细胞的发展和功能。本文通过线性噪声逼近方法调查胞内代谢网络中的噪声传播。通过分析几种典型的途径可知...
陈爱敏
关键词:网络结构协方差矩阵
文献传递
噪声诱导多细胞系统的同步切换被引量:1
2008年
在以往的工作中讨论了对单细胞的基因开关系统噪声如何诱导连贯切换.在此,对多细胞的基因开关网络系统研究各种噪声(包括细胞内噪声和细胞环境噪声)对同步切换的影响.发现:细胞内基因调控过程中的合成率和降解率的随机涨落以及细胞内的附加噪声均能够诱导群体基因开关系统的同步切换,而且存在一个最优的噪声强度,它使得这种同步切换的效果最佳.另一方面,细胞环境的随机涨落所导致的噪声(即环境噪声),不但能诱导上述同步切换,而且当细胞内噪声不足以诱导细胞群体的同步切换时,它通过压制内部噪声来达到增强群体系统的协作行为.最后,还分析了受噪声影响的信号分子的扩散率对细胞群体切换行为的影响.
张家军王军威苑占江周天寿
关键词:噪声
环境噪声诱导基因状态间的同步切换
以前的研究表明:细菌群体感应机制能够促使相互作用的多细胞系统的群体同步(包括随机同步和同步切换等)。本文研究了公共的、噪声的信号小分子能否诱导相互独立的多细胞基因开关系统的同步切换。在同质细胞的情形,这种信号小分子通过调...
王军威周天寿
关键词:噪声
文献传递
Output Feedback H~∞ Control for a Class of Nonlinear Stochastic Systems
2010年
This paper deals with the output feedback H∞ control problem for a class of nonlinear stochastic systems. Based on the latest developed theory of stochastic dissipation, a notable result about the nonlinear H∞ output feedback control of deterministic system is generalized to the stochastic case. Finally, in the cases of state feedback and output feedback, two families of controllers are provided respectively.
Yuan-Hua Ni
A new mammalian circadian oscillator model including the cAMP module
2009年
In this paper, we develop a new mathematical model for the mammalian circadian clock, which incorporates both transcriptional/translational feedback loops (TTFLs) and a cAMP-mediated feedback loop. The model shows that TTFLs and cAMP signalling cooperatively drive the circadian rhythms. It reproduces typical experimental observations with qualitative similarities, e.g. circadian oscillations in constant darkness and entrainment to light dark cycles. In addition, it can explain the phenotypes of cAMP-mutant and Rev-erba^-/^- -mutant mice, and help us make an experimentally-testable prediction: oscillations may be rescued when arrhythmic mice with constitutively low concentrations of cAMP are crossed with Rev-erba^-/- mutant mice. The model enhances our understanding of the mammalian circadian clockwork from the viewpoint of the entire cell.
王军威周天寿
关键词:MAMMALSCAMP
共2页<12>
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