广西壮族自治区自然科学基金(2013GXNSFAA019034)
- 作品数：14 被引量：49H指数：3
- 相关作者：易忠胜张爱茜王海洋董露杨雾更多>>
- 相关机构：桂林理工大学中国科学院生态环境研究中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金环境化学与生态毒理学国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：理学环境科学与工程化学工程医药卫生更多>>
- 计算模拟与光谱法研究4-羟基-2,2’,3,4’-四溴二苯醚与人血清白蛋白的相互作用被引量：2
- 2017年
- 利用分子模拟、荧光光谱、紫外吸收光谱等方法,研究了4-羟基-2,2’,3,4’-四溴二苯醚(4-OHBDE-42)与人血清白蛋白(HSA)的相互作用。三维荧光分析表明,4-OH-BDE-42的存在降低了HSA的荧光强度,且使HSA的微环境和构象发生变化。荧光光谱和紫外吸收光谱显示,4-OH-BDE-42与HSA结合后显著猝灭了HSA的内源性荧光,猝灭机制为静态猝灭与非辐射能量转移。结合常数Ka>106L·mol-1,表明两者的结合作用较强,结合距离r为3.66nm。根据热力学参数分析,ΔH>0,ΔS>0,即4-OH-BDE-42与HSA之间结合的主要作用力为疏水作用,这与分子对接、结合自由能分析结论一致。结合自由能贡献分析表明,LYS199、GLU292、ARG257、ARG218、ALA291、HIS242为4-OH-BDE-42与HSA结合的关键氨基酸残基。
- 杨露露杨雾伍智蔚易忠胜
- 关键词：人血清白蛋白光谱法相互作用
- 分子荧光光谱法结合分子动力学模拟研究2′-OH-BDE-68与HSA的相互作用被引量：2
- 2017年
- 结合分子荧光光谱法、分子对接和分子动力学模拟等方法研究了在生理条件(pH 7.40)下2′-羟基-2,3′,4,5-四溴二苯醚(2′-OH-BDE-68)与人血清白蛋白(HSA)的相互作用及其对HSA构象的影响。结果表明:1 2′-OH-BDE-68对HSA内源性荧光的猝灭属静态猝灭和非辐射能量转移过程;2两者之间的反应是以疏水作用力为主辅以微弱的静电作用的自发反应过程;3 2′-OH-BDE-68与HSA的结合在10ns内趋于平衡,结合位点在SiteⅠ;4复合物的形成使HSA分子中的色氨酸的疏水性增加,从而HSA的二级结构发生改变。
- 李志娟韦明奉韦勇伍智蔚易忠胜
- 关键词：分子对接分子动力学模拟人血清白蛋白
- 5'-羟基-2,2',4,4',5-五溴二苯醚与人血清白蛋白结合特征研究被引量：3
- 2016年
- 在模拟生理环境下,通过稳态荧光光谱、时间分辨荧光光谱、傅立叶变换红外光谱和三维荧光光谱等方法研究了5'-羟基-2,2',4,4',5-五溴二苯醚(5'-OH-BDE-99)与人血清白蛋白的结合特征,并结合分子对接与分子动力学模拟技术对其作用机制进行了分析。荧光光谱实验、非辐射能量转移理论及动力学模拟研究表明,5'-OH-BDE-99能使HSA发生猝灭作用,且猝灭机制为静态猝灭。傅立叶变换红外光谱、三维荧光光谱及动力学模拟研究表明,5'-OH-BDE-99可诱导HSA构象和周围环境发生变化。此外,分子对接和热力学方法研究表明,二者间的主要作用力为疏水作用力。
- 杨雾杨露露伍智蔚易忠胜
- 关键词：多溴二苯醚人血清白蛋白分子对接动力学模拟
- 全氟丙酸与人血清白蛋白结合作用机制的计算模拟与光谱法研究被引量：1
- 2015年
- 通过分子对接和动力学模拟的计算方法模拟人血清白蛋白(HSA)的三维空间结构,建立了HSA与全氟丙酸(IPC-PFFA-3)相互作用的模型,研究了HSA与全氟丙酸复合物在水溶液中的稳定性以及在结合位点中的动力学性质。在模拟人体生理的实验条件下,采用荧光光谱法和同步荧光光谱法研究了HSA与IPCPFFA-3的相互作用。实验结果表明,IPC-PFFA-3与HSA形成的复合物HSA-IPC-PFFA-3对HSA产生荧光猝灭作用,其猝灭机理是静态猝灭;热力学参数计算得出两者结合的主要作用力为氢键作用力;竞争实验的结果表明IPC-PFFA-3与HSA的结合位点位于HSA的SiteⅡ,与分子对接的模拟结果相吻合。同步荧光光谱实验与动力学模拟的结果证明IPC-PFFA-3与HSA能够稳定结合,并使HSA的构象发生变化。
- 易忠胜王海洋伍智蔚张爱茜
- 关键词：动力学模拟荧光光谱法
- 结合光谱法和计算模拟多角度分析2,2′,4,4′,5-五溴二苯醚与人血清白蛋白的作用机制被引量：3
- 2016年
- 本文结合光谱法、动力学模拟(MD)和分子对接等手段,多角度地研究了2,2′,4,4′,5-五溴二苯醚(BDE-99)与人血清白蛋白(HSA)在pH=7.4模拟生理环境下的相互作用机制.首先采用MD从理论上模拟BDE-99与HSA相互作用的构象变化情况;然后利用同步荧光和三维荧光光谱法从实验角度进行验证,所得结果表明,BDE-99使HSA的疏水性增强从而导致其构象发生变化.同时,荧光光谱和紫外光谱得出BDE-99对HSA的猝灭机制属于静态猝灭和非辐射能量转移.另外,分子对接结果显示,BDE-99通过静电引力和疏水作用力结合在HSA的位点I处,这与竞争实验和热力学参数的分析结果是一致的.实验数据与模拟计算结果的相互印证,为进一步探究BDE-99和HSA的相互作用机制提供了重要的信息和参考依据.
- 董露易忠胜伍智蔚王海洋张爱茜
- 关键词：光谱法分子对接动力学模拟人血清白蛋白
- 基于对接的植物激素3D-QSAR和分子动力学模拟被引量：3
- 2014年
- 采用分子对接和分子动力学(MD)模拟方法研究植物雌激素类化合物与雌激素受体的相互作用机制,对接结果表明,雌激素受体活性位点的疏水和氢键作用是影响植物雌激素化合物活性的主要原因,植物雌激素类化合物主要与氨基酸残基GLU353、ARG394、HIS524和LEU525之间形成氢键.然后以对接后的分子构象进行分子结构叠合,结合比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法建立了3D-QSAR模型.CoMFA模型的交叉验证相关系数(Q2)和非交叉验证相关系数(R2)值分别为0.676和0.994,标准估计误差SEE和F统计量分别为0.143和342.115;CoMSIA模型的Q2=0.565,R2=0.972,SEE=0.286和F=111.480.结果表明,CoMFA和CoMSIA模型具有良好的稳定性和预测能力,可为植物雌激素的雌激素效应研究提供有力的支持.采用MD模拟研究了小分子和受体蛋白的动力学情况,为对接结果的合理性提供了验证.
- 蒙延娟易忠胜艾芳婷张爱茜
- 关键词：植物雌激素三维定量构效关系比较分子力场分析分子动力学模拟
- 模拟和光谱相互验证2＇-OH-BDE-28对HSA构象的影响被引量：2
- 2016年
- 利用分子对接、分子动力学模拟(molecular dynamics simulation,MD)和光谱法研究2'-羟基-2,4,4'-三溴二苯醚(2'-OHBDE-28)与人血清白蛋白(HSA)的作用机制。MD模拟研究表明2'-OH-BDE-28诱导HSA的内部疏水性增强,结构松散膨胀,致使其二级结构发生改变;圆二色光谱实验与MD模拟结果相吻合,验证2'-OH-BDE-28可诱导HSA的构象变化。荧光光谱实验表明,2'-OH-BDE-28能通过静态猝灭和非辐射能量转移机制引起HSA荧光猝灭。分子对接推断2'-OH-BDE-28以氢键和疏水作用力键合在HSA的位点I处;热力学分析和竞争实验结果一致验证分子对接结果。本文将计算模拟和光谱实验相结合,从模拟和实验2个角度共同探讨2'-OH-BDE-28与HSA的作用机制,结果高度吻合。
- 伍智蔚易忠胜董露杨露露杨雾张爱茜
- 关键词：人血清白蛋白分子动力学模拟光谱法
- 2,3,3'-三氯联苯与人血清白蛋白之间相互作用的计算模拟及光谱研究
- 2014年
- 利用分子对接、分子动力学模拟、荧光光谱、紫外光谱及同步荧光光谱法研究了2,3,3'-三氯联苯(PCB-20)与人血清白蛋白(HSA)的相互作用。分子对接结果表明,PCB-20与HSA通过疏水作用力稳定结合于HSA的疏水空腔内。光谱法实验结果表明,PCB-20通过与HSA形成HSA-PCB20复合物从而对HSA具有荧光猝灭作用,猝灭原因是静态猝灭和非辐射能量转移,热力学参数也表明两者结合的主要驱动力为疏水作用力,计算模拟与实验结果吻合度较高。分子动力学模拟结果表明,PCB-20能够与HSA稳定结合,且与同步荧光光谱实验共同证明其对HSA的构象变化产生了一定影响。
- 艾芳婷易忠胜蒙延娟张爱茜
- 关键词：HSA分子对接分子动力学模拟光谱法
- 碳点-钙黄绿素荧光共振能量转移体系在山奈素检测中的应用研究被引量：7
- 2014年
- 研究了碳点（CDs）-钙黄绿素（cA）能量转移体系，并利用该体系建立了测定山奈素（KF）的新方法。在λex=320nm下，pH8．0的磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液中，CDs与CA能发生有效的能量转移，使得cA的荧光增强，而KF的加入则可有效猝灭CA的荧光，且在一定范围内cA的荧光猝灭值与KF的加入量呈良好的线性关系，基于此建立了测定KF的新方法。在最佳实验条件下，方法的线性范围为1．0×10^-8～3．4×10^-6mol／L，检出限为3．33×10^-9mol／L。方法应用于复方金银花颗粒中KF含量的测定，回收率为98．4％-103．5％．RSD（n=6）不大于2．7％
- 陶慧林廖秀芬周素莲钟福新易忠胜陈俊
- 关键词：钙黄绿素荧光共振能量转移山奈素
- 小分子与人血清白蛋白相互作用研究方法的进展被引量：3
- 2016年
- 对1958年至2015年期间应用光谱法、亲和色谱法、毛细管电泳法、等温滴定量热法、分子对接和动力学模拟法等方法研究小分子与人血清白蛋白相互作用的进展作了评述,并对其发展方向作了展望。
- 杨雾易忠胜杨露露伍智蔚
- 关键词：人血清白蛋白光谱法毛细管电泳法
