福建省重大科研项目(2003F003) 作品数:7 被引量:14 H指数:3 相关作者: 王少元 王程毅 李景岗 张轶文 黄源茂 更多>> 相关机构: 福建医科大学 更多>> 发文基金: 福建省重大科研项目 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
家族性急性髓系白血病相关新基因FAMLF cDNA全长的克隆及其生物功能分析 被引量:3 2008年 目的克隆家族性急性髓系白血病(AML)相关新基因cDNA全长,在分子水平上探讨急性白血病发生发展的机制。方法以构建的家族性AML抑制性消减文库中1个有差异表达的新基因EST序列zywb87(GenBank注册号CV973101)为基础,应用cDNA末端快速扩增法(RACE)克隆其全长cDNA,应用生物信息学对其功能进行初步分析,应用一步法半定量RT—PCR检测其在AML患者及正常人中的表达。结果获得了家族性AML相关新基因FAMLF的cDNA全长,该基因定位于染色体1q31.3,cDNA全长2313bp,开放读码框(ORF)为249bp,编码82个氨基酸的蛋白质,含有信号肽,富含亮氨酸重复单位(LRR—SD22),内在固有无序结构域等功能区。Blast检索为功能未知的新基因,已被GenBank收录,并命名为FAMLF,核酸注册号为EF413001,蛋白质注册号为ABN58747。新基因FAMLF在AML患者中的表达明显高于正常人,差异有统计学意义(2.61±0.66 vs 0.97±0.51,P〈0.01)。结论成功获得一个家族性AML相关新基因FAMLF cDNA全长,FAMLF基因在AML中高表达,可能是具有一定生物功能的新基因。 李景岗 王少元 黄源茂 王程毅关键词:髓样 基因 克隆 计算生物学 一个家族性急性髓系白血病家系的调查分析 被引量:2 2009年 家族性白血病是指具有家庭或家族聚集性质的白血病或白血病前期。同散发性白血病相比,是指一个家庭或家族中发生1例以上的白血病。家族性白血病的发生发展与其遗传因素关系密切,是研究急性白血病(AL)发病机制的重要基因资源。本课题组对国内最大的一个白血病高发家系进行了长达数十年的跟踪随访调查,并对其进行了家系调查及细胞遗传学水平的研究,现把结果报道如下。 王敏 王少元 张轶文 黄源茂 王程毅 李景岗关键词:家族性白血病 白血病前期 急性髓系 病家系 细胞遗传学 cDNA末端快速扩增技术及其在血液疾病上的应用 被引量:2 2007年 克隆新基因及获得其cDNA全长是现代生命科学中研究基因功能的重要前提。以PCR为基础的cDNA末端快速扩增(RACE)技术是一种简单、敏感且有效扩增cDNA全长的方法。该文主要概述RACE技术的原理、进展及其在血液疾病基因克隆方面的应用。 王程毅 王少元关键词:RACE 全长CDNA 家族性急性髓系白血病相关新基因ELF2C cDNA全长的克隆 被引量:4 2007年 目的克隆家族性急性髓系白血病相关新基因全长,在分子水平上探讨急性白血病发生发展的机制。方法以构建的家族性急性髓系白血病抑制性消减性文库中1个有差异表达的新基因 EST 序列(zywb4)为基础,综合应用电子克隆和 cDNA 末端快速扩增法(RACE)技术克隆家族性急性髓系白血病相关新基因的全长 cDNA。结果获得家族性急性髓系白血病差异表达新基因 ELF2C的全长 cDNA 和432 bp 的开放阅读框(ORF),Blast 检索为一功能未知基因,被 GenBank 收录,注册号为 DQ359746。结论成功获得一个家族性急性髓系白血病相关新基因 ELF2C cDNA 全长,为进一步研究其功能提供了依据。 王程毅 王少元 林旭 张轶文 李景岗关键词:系谱 粒细胞 基因 克隆 RACE 一条家族性急性髓系白血病相关新基因ELF2C的生物信息学分析 2009年 目的利用生物信息学技术对新克隆的家族性急性髓系白血病相关新基因ELF2C和其蛋白序列进行分析,初步探讨其功能。方法以人类基因组数据库为基础,利用生物信息学程序预测ELF2C的基因结构、染色体定位、编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位、蛋白质功能域等。结果ELF2C基因定位于4q31.1,全长2257bp,含有432bp的开放阅读框,可编码143氨基酸的蛋白质,且编码蛋白定位于核内,具有多个修饰位点和功能基序,是一个功能活跃的蛋白质。结论ELF2C基因可能是在家族性急性髓系白血病发生发展中具有生物功能的一条全长新基因。 王程毅 王少元 张轶文 李景岗关键词:系谱 白血病 基因 计算生物学 家族性急性髓系白血病差异表达基因的筛选与鉴定 被引量:6 2007年 目的分离家族性急性髓系白血病患者骨髓中差异表达的基因,在基因水平上探讨急性白血病发生发展的分子机制。方法应用 Super SMART 和抑制性消减杂交(SSH)技术,构建家族性急性髓系白血病 cDNA 消减文库;应用差异筛选技术进行差异表达片段的筛选与鉴定;测序结果进行 BLAST 同源性比对分析。结果成功构建了家族性急性髓系白血病 cDNA 消减文库;克隆、筛选并鉴定了17条基因片段,与已知基因同源,11条为未知基因片段。结论 SSH 技术是筛选差异表达基因的有效方法;获得多个与细胞增殖和分化相关的已知基因;获得11条新基因 EST 片段,并被GenBank 收录。 张轶文 王少元 林旭 王程毅关键词:急性白血病 粒细胞 基因表达调控 系谱 抑制性消减杂交 核糖体蛋白RPL36A siRNA对U937细胞的促增殖、抑凋亡作用 被引量:2 2010年 本研究探讨RPL36A基因在急性髓系白血病(AML)病人的表达情况及可能的作用机制。应用RT-PCR检测急性髓系白血病细胞、正常人单个核细胞、U937细胞中RPL36A基因的表达情况;RPL36A siRNA经脂质体介导转入U937细胞,采用MTT法及DNA倍体分析检测细胞增殖,AO/EB、TUNEL、Annexin V/FITV检测细胞凋亡,RT-PCR和Western blot检测RPL36A基因及蛋白表达水平的变化。结果表明:RPL36A在初治AML细胞和U937细胞中表达明显增高;MTT法及DNA倍体分析发现,U937细胞增殖受到抑制,细胞周期阻滞;AO/EB染色、TUNEL、Annexin V/FITV检测显示,转染RPL36A siRNA的细胞组凋亡率高于对照组;RPL36A siRNA作用可引起U937细胞的RPL36A的mRNA水平的降低和蛋白表达量的下降,且呈时间依赖性(r分别为0.9813和0.9537)。结论:AML细胞高表达RPL36A基因,RPL36A基因的高表达可能促进AML细胞的过度增殖并抑制其凋亡。 吴丽明 王少元 王少雄 黄源茂 李景岗关键词:核糖体蛋白 急性髓系白血病 U937细胞