国家自然科学基金(31372431) 作品数:15 被引量:48 H指数:6 相关作者: 程天印 严芬 段德勇 唐欢 杨亚 更多>> 相关机构: 湖南农业大学 信阳农林学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 生物学 更多>>
不同饱血状态微小牛蜱中肠和唾液菌群结构的分析 被引量:3 2017年 旨在探明微小牛蜱随吸血时间的延长,中肠和唾液微生物菌群结构的差异,以及优势菌属在中肠和唾液中增殖和迁移的特点。在无菌条件下采集半饱血、饱血微小牛蜱唾液和中肠内容物;提取细菌总DNA,PCR扩增其16SrDNA V3-V4区,Illumina MiSeq双端测序;对序列进行拼接和过滤、OTUs聚类、物种注释及多样性分析。结果显示,共得到134 317条序列,聚类后获得1 304个OTUs,半饱血雌成蜱唾液(SP)、饱血雌成蜱唾液(SF)、半饱血雌成蜱中肠内容物(MP)、饱血雌成蜱中肠内容物(MF)分别获得336、332、269、289个OTUs,其中152个OTUs为4个样本共有;4个样品在门水平上,以变形菌门和厚壁菌门为优势菌门,变形菌门在中肠中的含量大于唾液,而厚壁菌门反之;在属水平上,4个样本以柯克斯体属、不动杆菌属、甲基杆菌属、短波单胞菌属、立克次体属、埃希菌属为优势菌属,其中柯克斯体属、不动杆菌属在4个样本中含量均较大,柯克斯体属在半饱血状态下,含量高于饱血状态;不动杆菌属在唾液中的含量高于中肠。结果表明,微小牛蜱中肠和唾液中有复杂的微生物菌群结构;细菌在不同组织中的分布不同,其含量随吸血时间的延长而发生变化。 段德勇 程天印关键词:微小牛蜱 唾液 中肠 菌群结构 体视显微镜照相常见问题改进——以蜱显微照相为例 2013年 基于传统显微照相存在的问题和遇到的困难,我们在实际操作中总结了三种改进体视显微照相的方法即利用伽马校正、LED高亮内聚光电光源和球形体视显微载物台,使得拍摄工作简单有效,图片更为自然。 严芬 杨磊 程天印关键词:伽马校正 褐黄血蜱热休克蛋白70家族的克隆、表达及抗凝血功能研究 褐黄血蜱是我国常见蜱种之一,主要侵袭猪、犬、黄牛和刺猬等脊椎动物。它携带新布尼亚病毒、蜱传脑炎病毒和立克次体等多种病原体,具有潜在公共卫生意义。为筛选功能蛋白分子,探索新的控蜱方案,本研究采用LC-MS/MS技术分析褐黄... 和小明关键词:热休克蛋白70 克隆 抗凝血 文献传递 微小牛蜱核糖体ITS及线粒体基因测序与分析 微小牛蜱是寄生于家畜体表最常见的蜱类之一,多寄生于牛,叮咬后会引起皮炎和贫血,并可以充当许多致病微生物的传播媒介。微小牛蜱有许多的分支(A-E分支),因此通过形态特征、寄主或地理来源等方法达到准确鉴定和区分微小牛蜱及其亲... 伊佳宁关键词:微小牛蜱 线粒体基因 线粒体全基因组 系统发育 文献传递 褐黄血蜱cystatin基因全长的克隆及原核表达研究 2018年 为了探讨褐黄血蜱体内半胱氨酸蛋白抑制剂(cystatin)蛋白及其编码基因的情况,试验基于褐黄血蜱唾液腺转录组数据库中搜索的注释为cystatin的contig_43533序列设计引物,RACE扩增其5′端和3′端,拼接获得cDNA全长,利用生物信息学软件进行分析;以饱血褐黄血蜱雌成虫全蜱总cDNA为模板,扩增cystatin-ORF,构建重组表达载体,原核表达、纯化制备cystatin重组蛋白。结果表明:褐黄血蜱cystatin cDNA全长635 bp,包含396 bp的开放阅读框架,编码一个含131个氨基酸残基的蛋白,原核表达可获得褐黄血蜱cystatin重组蛋白。说明褐黄血蜱cystatin蛋白能在大肠杆菌内以可溶性形式稳定表达。 和小明 刘磊关键词:半胱氨酸蛋白酶抑制剂 基因全长 原核表达 褐黄血蜱的形态学与分子生物学鉴定 被引量:13 2015年 鉴定采自河南信阳、湖南华容、山西太谷刺猬、犬的蜱。借助体视显微镜对蜱样进行形态观察;克隆、分析其COX1与ITS1序列,对比分析同源性并构建系统发生树。形态学鉴定和分子生物学鉴定结果表明,采自河南信阳、湖南华容、山西太谷刺猬、犬体表的蜱均为褐黄血蜱。湖南、河南、山西也成为褐黄血蜱的分布地。 严芬 程天印关键词:形态学鉴定 ITS1 分子生物学鉴定 系统发生树 硬蜱常用分子分类技术研究进展 被引量:5 2014年 蜱类系统分类学研究已经进入分子阶段,与传统的形态学、生物学鉴定相比,无疑更加客观准确,建立系统进化树更能全面反映其亲缘关系,极大地提高了鉴定效率与可信度。论文总结了近年来应用分子生物学技术鉴定硬蜱的主要方法,包括核酸序列分析、随机扩增DNA多态性分析、限制性片段长度多态性分析。随着分子生物学和现代统计学的广泛应用,蜱类的鉴定将更加依赖现代分类学方法。 杨亚 刘进辉 伏健 严芬 程天印关键词:硬蜱 分子生物学技术 绵羊虱蝇中肠和蛹菌群结构的分析 被引量:7 2017年 为探明绵羊虱蝇雌、雄成虫中肠及蛹的菌群结构特点,提供防控绵羊虱蝇及其传播疾病的科学依据,本研究在无菌条件下采集雌、雄绵羊虱蝇成虫中肠内容物及蛹内容物,用试剂盒提取细菌总DNA,运用通用引物PCR扩增细菌16S r DNA V3区,DGGE电泳,选取优势条带,回收、测序,测序结果与Gen Bank数据库中已知序列进行比对。结果显示,雌、雄绵羊虱蝇成虫中肠及蛹的优势菌均为巴尔通氏体、杀雄菌、沃尔巴克氏体。研究结果表明,雌、雄绵羊虱蝇成虫中肠及蛹的菌群结构相似,且巴尔通氏体、杀雄菌、沃尔巴克氏体可垂直传播。 汪雅琴 程天印 段德勇关键词:DGGE 中肠 菌群结构 镰形扇头蜱唾液腺、中肠和卵的菌群结构 被引量:3 2015年 采用PCR-DGGE技术分析了镰形扇头蜱雌成蜱中肠内容物、唾液腺、虫卵的菌群结构。无菌条件下采集镰形扇头蜱雌成蜱中肠内容物、唾液腺、虫卵,提取细菌总DNA;以通用引物扩增细菌16SrDNA V3区;DGGE电泳,回收、克隆、测定DGGE优势条带。结果表明,饱血和半饱血雌蜱中肠菌群结构相同,中肠内容物、唾液腺和虫卵部分细菌相同;9条明显条带的序列分别与柯克斯体属(Coxiella sp.)、假单胞菌属(Pseudomonas sp.)芽孢杆菌属(Bacillus sp.)、葡萄球菌属(Staphylococcus sp.)、涅斯捷连科菌属(Nesterenkonia)、共生菌(Symbiotic bacteria)和未培养土壤细菌的16SrDNA V3区序列高度相似。分离到2株细菌,为模仿葡萄球菌和蜡样芽孢杆菌。 严芬 徐兴莉 杨亚 刘瑞昆 程天印关键词:PCR-DGGE 镰形扇头蜱 唾液腺 中肠 虫卵 羊源长角血蜱吸血后中肠优势菌群分析 被引量:7 2015年 本研究采用PCR-DGGE技术分析长角血蜱的中肠菌群结构。无菌条件下采集长角血蜱中肠内容物,以细菌基因组DNA提取试剂盒提取内容物细菌总DNA,以通用引物扩增制备16S r DNA V3区,DGGE电泳分离后,切胶回收、测定序列。结果表明,长角血蜱饱血雌成蜱中肠优势菌为泛菌属、柯克斯氏体属、肠杆菌属、绿脓杆菌属、假单胞菌属、克雷伯氏菌属、欧文氏菌属,但半饱血雌成蜱和雄成蜱中肠未检测到柯克斯氏体属(Coxiella)。 廖芷卉 陈宏智 唐昊 程天印关键词:PCR-DGGE 长角血蜱