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基于谷歌地图的传染病空间聚集性分析被引量：5: 2014年; 目的探讨谷歌地图在传染病空间聚集性分析中的应用,探索以社区(行政村)为单位进行空间聚集性分析。方法利用谷歌地图的地理译码技术和计算几何算法以及文本解析方法,将宁波市镇海区2005-2010年结核病的报告数据和模拟数据,转换成以社区(行政村)为单位的发病统计数据,以此为基础利用SaTScan进行扫描统计分析,比较以街道为单位和以社区(行政村)为单位进行空间聚集性分析的结果。结果无论是以街道为单位还是以行政村为单位的聚集性分析,均发现镇海区蛟川街道2005-2010年具有明显的结核病空间聚集性现象,而以行政村为单位的聚集性分析更精确地给出主要聚集区位于中官路村、五里牌村和俞范社区等行政村。对镇海区招宝山街道模拟数据的分析表明,以社区为单位进行聚集性分析能够在早期发现街道内部小范围的空间聚集性,这与以街道为单位进行聚集性分析着重发现较大范围的空间聚集性形成互补。结论谷歌地图及其地理译码技术在传染病空间聚集性分析中具有广阔的应用前景,以社区(行政村)为单位进行空间聚集性分析具有可行性和现实意义。; 袁东方应莉娅刘志芳罗旭红董长征; 关键词：空间聚集性谷歌地图

人肠道病毒71型与手足口病的分子流行病学及其分子进化被引量：31: 2015年; 人肠道病毒71血清型(Enterovirus 71,EV71)是手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)的主要病原体之一,除了引起手、足和口腔等部位出现疱疹的手足口病典型症状,还能引起无菌性脑膜炎和急性迟缓性麻痹等神经系统并发症并致死亡。EV71在历史上曾经造成多起手足口病疫情,尤其是1997年之后,在亚太地区发生了大规模的手足口病疫情,造成了大量的手足口病病例和死亡病例。手足口病尚无上市疫苗和抗病毒药物,主要依赖对症治疗,因此对EV71的分子流行病学和分子进化研究对手足口病的监测和防控具有重要意义。文章对EV71基因型的分类、时空分布、进化特征和模式以及所造成的代表性疫情进行了综述,为EV71致病机制、抗病毒药物和疫苗的研究以及对手足口病疫情的监测和防控提供启发。; 刘志芳桂娟娟华启航董长征; 关键词：手足口病肠道病毒71型基因型

控制图预警模型及其Excel实现被引量：9: 2013年; 目的通过Microsoft Excel实现5种主要的控制图预警模型(休哈特控制图、基于长期基线数据的累积和控制图、基于短期基线数据的累积和控制图、移动平均控制图和指数加权移动平均控制图)。方法利用Excel函数功能计算各种类型控制图的预警统计量和预警上线。结果以宁波市镇海区2006—2011年乙型肝炎每月报告发病数据作为模板,通过Excel表格和图形可以进行传染病预警分析。结论控制图预警模型的Excel程序Excel CC可用于传染病的回顾性和前瞻性时间预警分析。; 刘志芳袁东方董长征; 关键词：控制图预警模型 EXCEL

传染病预警模型研究进展被引量：14: 2012年; 2003年传染性非典型肺炎（SARS）和2009年甲型H1N1流感的全球暴发表明传染病依然是生命健康和社会经济的重大威胁。经济全球化、生产国际化、交通更加便捷、人货流动加快等因素的影响,使得传染病的传播速度加快、传播范围更广,也加大了传染病的防控难度。及早探测到传染病的早期暴发并发出预警和采取应对措施,; 袁东方应莉娅董长征; 关键词：预警模型传染病甲型H1N1流感传染性非典型肺炎经济全球化

甲型流感病毒基因组进化事件检测软件的实现: 2011年; 目的流感病毒通过跨宿主迁移和基因组重配作用等进化事件引起抗原转换是造成流感大流行的主要原因;传统上利用系统发生树通过进化分析检测这些事件,而进化分析过程复杂并且算法参数较难设定。方法作者曾提出了一种利用基因型谱检测甲型流感病毒基因组进化事件的新方法,弥补了进化分析的这些缺陷。在本文中,利用C++Builder开发工具在Windows平台上实现了基因型谱分析方法。结果利用甲型流感病毒进化事件检测软件,可以快速的检测跨宿主迁移和基因组重配作用等甲型流感病毒基因组进化事件。结论甲型流感病毒进化事件检测软件可以作为流感病毒疫情监测控制中进化分析的辅助工具,无论在病毒基因组进化的基础研究和疾控实践中都将具有很强的应用价值。; 应莉娅袁东方董长征; 关键词：迁移

流感病毒基因组进化研究进展被引量：6: 2011年; 流感病毒先后造成了1918、1957、1968和2009年等多次全球性大流感,对人类的生命健康和社会生活形成了巨大的威胁。流感病毒的基因组进化研究为揭示病毒致病机理、疫情监测、准备疫苗和研发抗病毒药物提供了巨大的帮助。文章以流感病毒基因组进化机制为核心,结合与基因组进化密切相关的抗原性和抗药性等表型进化,对流感病毒基因组进化研究的相关进展予以介绍。; 董长征; 关键词：流感病毒基因组进化抗原性抗药性

浙江省2005—2011年肺结核流行特征与空间聚集性被引量：20: 2016年; 目的分析浙江省2005-2011年肺结核的流行特点，探讨其空间聚集特征。方法综合肺结核报告发病率、空间自相关分析法和单纯空间扫描统计量，以区县级为单位对浙江省2005-2011年肺结核监测数据进行分析。结果2005-2011年浙江省90个区县共报告新发肺结核239080例，年均报告发病率为67．50／10万。发病以男性为主，男女占比为2．18：1；年龄分布以15—60岁为主，占75．5％；职业分布以农民为主，占44．9％，其次是民工和工人，分别占22．0％和10．2％。空间自相关分析和单纯空间扫描统计量均发现浙江省西部衢州市的绝大多数区县以及杭州市的部分区县为肺结核高发病率聚集地区，而嘉兴市、宁波市和丽水市则为低发病率聚集地区。结论浙江省肺结核发病率总体呈下降趋势，发病率低于全国平均水平；农村的男性青壮年是肺结核主要易感人群；衢州市是浙江省肺结核的主要发病聚集区域。; 桂娟娟张添方刘志芳华启航陈彬顾华董长征; 关键词：肺结核空间聚集性空间自相关

利用Monte-Carlo模拟评价基因水平的关联分析方法: 2015年; 采用Monte-Carlo模拟了多种参数条件下的遗传关联数据,计算多种基因水平的关联分析方法的统计效能.结果显示:主成分Logistic回归分析(累积贡献率为95%)和我们之前发展的基于LD结构和Fisher组合法的新方法(LD-Fisher)在多种参数条件下都具有很高的统计效能,Fisher组合法只有在单个易感SNP的P值较小时或者存在多个P值不太小的易感SNP时表现较好.主成分Logistic回归分析和LD-Fisher可以作为基因水平关联分析的较为理想的分析方法.; 桂娟娟罗旭红张添方华启航董长征; 关键词：MONTE-CARLO模拟

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