国际科技合作重点项目计划(2002AA217121)
- 作品数：4 被引量：57H指数：4
- 相关作者：唐纪良莫新春段承杰冯家勋许跃强更多>>
- 相关机构：广西大学中国科学院广西亚热带生物资源保护利用重点实验室更多>>
- 发文基金：国际科技合作重点项目计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学自然科学总论更多>>
- 堆肥未培养细菌的宏基因组文库构建及新的木聚糖酶基因的克隆和鉴定被引量：11
- 2005年
- 从自制堆肥样品中提取未培养细菌的总DNA,用柯斯质粒pW EB∷TNC为载体构建宏基因组文库,对文库进行筛选获得表达木聚糖酶活性的克隆,再进行亚克隆、测序分析以及B lastx搜索G enB ank分析木聚糖酶基因。结果构建得到一个包含约5万个克隆的宏基因组文库,文库中外源DNA总容量约为1.8×106kb,获得2个表达木聚糖酶活性的克隆:pGXN 1050和pGXN 1051,鉴定分析表明:pGXN 1050上潜在的木聚糖酶基因um xyn 11A具1个771bp的ORF(Open R ead ing F ram e),可编码含257个氨基酸的蛋白质,所编码产物与混合纤维弧菌(C ellv ibr io m ix tus)的内切-1,4-β-木聚糖酶(G enB ank索引号Z48925.1)的氨基酸序列有46%的一致性和57%的相似性;pGXN 1051上潜在的木聚糖酶基因um xyn 11B具一个723bp的ORF,可编码含241个氨基酸的蛋白质,编码产物与混合纤维弧菌的内切-1,4-β-木聚糖酶(G enB ank索引号Z48925.1)的氨基酸序列有73%的一致性和80%的相似性。木聚糖酶Um xyn11A和Um xyn11B都属于糖基水解酶家族11的成员。
- 张鹏段承杰庞浩封毅靳振江许跃强莫新春唐纪良冯家勋
- 关键词：细菌宏基因组文库木聚糖酶基因
- 牛瘤胃未培养细菌中一个β-葡萄糖苷酶基因umbgl3A的克隆及鉴定被引量：20
- 2005年
- 通过构建牛瘤胃未培养细菌的宏基因组文库,共获得12000个克隆,文库外源DNA总容量为4.2×108bp,筛选得到九个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆,并对其中的一个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆pGXN1009进行亚克隆,将β-葡萄糖苷酶基因定位在4.3kb的片段上。测序结果表明在4.3kb的片段上有一个全长为1956bp的ORF,编码一个可能的β-葡萄糖苷酶基因um-bgl3A,其编码产物与一个来源于小鼠大肠未培养细菌的β-葡萄糖苷酶(GenBankAcessionNO:AAX16378.1)一致性为63%、相似性为79%;与哈氏噬纤维菌(Cytophagahutchinsonii)的β-葡萄糖苷酶(GenBankAcessionNO:ZP-00308419)的一致性为50%、相似性为67%。利用SMART软件对Umbgl3A结构组件预测表明,Umbgl3A包含一个家族3糖基水解酶(glycosylhydrolase)功能域和一个家族3C糖基水解酶功能域。遗传进化分析表明umbgl3A基因可能是来自牛瘤胃微生物噬纤维菌属未培养的一个种。
- 赵广存段承杰庞浩封毅许跃强莫新春唐纪良冯家勋
- 关键词：牛瘤胃宏基因组
- 能降解天然纤维素的地衣芽孢杆菌GXN151的分离鉴定及其一个纤维素酶基因(cel5A)的克隆和测序分析被引量：22
- 2003年
- 从广西大学农场陈旧稻草堆中分离出1株具有降解天然纤维素稻草粉、甘蔗渣粉活性的细菌GXN151,经形态观察、16SrDNA序列分析和丙酸盐利用试验将其鉴定为地衣芽孢杆菌(Bacilluslicheniformis)。通过连接经BamHI酶切的pBluescriptKS(+)和回收得到的经Sau3AI部分酶切的GXN151的3～10kbDNA在大肠杆菌JM109中构建了该菌的含7099个克隆的基因文库,文库克隆中插入片段最大的为11.0kb,最小的为3.1kb,平均大小为4.6kb,含GXN151基因组中任一基因的概率P为99.6%。筛选该文库获得8个表达羧甲基纤维素酶活性的克隆,DNA测序和PCR分析表明,该8个克隆可归为3类不重叠的独立克隆,其中一个克隆pGXNL2的测序分析表明其上的cel5A基因为1626bp,可编码含542个氨基酸的羧甲基纤维素酶,Cel5A的N-末端的42个氨基酸具有信号肽特征,它的第66～321氨基酸为家族5糖基水解酶(glycosylhydrolase)功能域、第391～472氨基酸为家族3碳水化合物结合组件(carbohydrate-bind-ingmodule,CBM)。本工作首次报道地衣芽孢杆菌能降解结晶纤维素及从该种细菌中克隆到纤维素酶基因。
- 刘永生冯家勋段承杰莫新春柏学亮张成刚唐纪良马庆生
- 关键词：天然纤维素地衣芽孢杆菌降解
- 造纸废水纸浆沉淀物中未培养微生物纤维素酶基因的克隆和鉴定被引量：11
- 2006年
- 提取纯化造纸废水纸浆沉淀物的宏基因组DNA并构建16S rDNA文库,系统发育分析显示该环境中存在大量的未培养细菌且具有种类的多样性。以柯斯质粒为载体构建了1个含10000个克隆的宏基因组文库,文库容量为3.53×108bp。筛选文库得到2个表达内切葡聚糖酶活性的克隆、3个表达外切葡聚糖酶活性的克隆和2个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆。从表达不同活性的克隆中分别挑选活性最强的进行鉴定,得到3个新的纤维素酶基因umcel5L、umcel5M和umbgl3D。umcel5L、umcel5M和umbgl3D分别编码产生内切葡聚糖酶、纤维糊精酶和β-葡萄糖苷酶,其编码产物与已报道的纤维素酶一致性最高的分别为43%、48%和46%。这是第一次采用未培养方法对造纸废水纸浆沉淀物中的细菌多样性进行分析并从中克隆纤维素酶基因的报道。
- 许跃强段承杰周权能唐纪良冯家勋庞浩封毅莫新春郭鸿张鹏
- 关键词：细菌多样性未培养微生物宏基因组文库纤维素酶
