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山东省科技兴海项目(001164504)

作品数:1 被引量:47H指数:1
相关作者:顾谦群杨官品崔建洲宫庆礼申雪艳更多>>
相关机构:中国海洋大学更多>>
发文基金:山东省科技兴海项目国家科技攻关计划更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇微卫星
  • 1篇基因
  • 1篇基因组
  • 1篇红鳍
  • 1篇红鳍东方
  • 1篇红鳍东方鲀

机构

  • 1篇中国海洋大学

作者

  • 1篇申雪艳
  • 1篇宫庆礼
  • 1篇崔建洲
  • 1篇杨官品
  • 1篇顾谦群

传媒

  • 1篇中国海洋大学...

年份

  • 1篇2006
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
红鳍东方鲀基因组微卫星特征分析被引量:47
2006年
对河豚基因组微卫星分布特征进行研究,在约365Mb基因组序列中共找到49647个微卫星序列,平均每隔7351个碱基就有1个。微卫星序列长度主要分布在20~60个碱基的长度范围内。全部微卫星序列重复区长度(2802374bp)占整个基因组的比例为0.77%。两碱基重复类型数目最多,为35339个,占总数的71.30%;其次是四碱基类型,6837个,占13.77%;再次分别是三碱基类型3548个,占7.1496。五碱基类型1856个,占3.73%,六碱基类型1605个,占3.23%,单碱基类型最少,共402个。占0.80%。按降序排列,出现最多的前20个微卫星重复类别为:CA,TG,GT,AC,GA,CT,TC,TA.AG,AT,TCCA,ATCC,TCTG,GATG,ATCT,CATC,TGGA,ATGG,GATA,GAG,占全部微卫星序列的75.21%。在河豚基因组中未发现CC微卫星序列的存在。与其它生物基因组中微卫星分布特征相比,河豚基因组具有更高的简洁性。本研究将为研究河豚微卫星标记、研究其群体遗传多样性,进行不同基因组的比较研究提供基础。
崔建洲申雪艳杨官品宫庆礼顾谦群
关键词:微卫星基因组
共1页<1>
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