董珊珊
所属机构: 云南省地方病防治所 所在地区: 云南省 研究方向: 医药卫生 发文基金: 国家自然科学基金
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王鹏 作品数:174 被引量:477 H指数:12 供职机构:云南省地方病防治所 研究主题:鼠疫 鼠疫菌 流行病学意义 鼠疫耶尔森菌 噬菌体 石丽媛 作品数:75 被引量:206 H指数:9 供职机构:云南省地方病防治所 研究主题:鼠疫 鼠疫菌 鼠疫耶尔森菌 耶尔森菌 纤溶酶原激活因子 郭英 作品数:92 被引量:296 H指数:12 供职机构:云南省地方病防治所 研究主题:鼠疫 鼠疫菌 鼠疫耶尔森菌 野鼠 流行病学 钟佑宏 作品数:93 被引量:208 H指数:8 供职机构:云南省地方病防治所 研究主题:鼠疫 噬菌体 鼠疫疫源地 流行病学意义 疫源地 张海鹏 作品数:53 被引量:94 H指数:8 供职机构:云南省地方病防治所 研究主题:鼠疫 鼠疫疫源地 噬菌体 流行病学意义 疫源地
剑川野鼠鼠疫疫源地鼠疫噬菌体的分离及其流行病学意义 被引量:16 2018年 目的 调查剑川野鼠鼠疫疫源地宿主动物中是否携带鼠疫噬菌体,并探讨其流行病学意义。方法 2017年1-6月采集剑川野鼠鼠疫疫源地4个曾流行过鼠疫乡镇6个自然村的鼠类标本,以鼠疫疫苗株EV76为饲养菌,采用双层平板法分离鼠疫噬菌体,并对分离结果进行流行病学分析,同时挑取部分噬菌体进行电镜扫描。结果 共获得641份标本(齐氏姬鼠334只,大绒鼠236只,其余71只),分离到9株鼠疫噬菌体,总分离率1.40%;有4个疫点(白山母村、石龙村、新松村、大庆村)分离到了鼠疫噬菌体,另外2个点(长乐村、西门社区)未分到鼠疫噬菌体;9株鼠疫噬菌体中,8株分离自齐氏姬鼠,1株自大绒鼠;初次分离这些鼠疫噬菌体时,其噬斑在双层平板上表现为大(直径~2.0 mm)、中(~1.0 mm)及小(<0.5 mm)3种噬斑;4株有代表性噬菌体皆为肌尾病毒科噬菌体。结论 剑川野鼠鼠疫疫源地中普遍存在鼠疫噬菌体,齐氏姬鼠是主要的携带宿主,所分鼠疫噬菌体为肌尾病毒科噬菌体且具有多态性,值得进一步研究。 钟佑宏 段存娟 郭英 董珊珊 张艳 安森玲 张海鹏 丁奕博 谭红丽 石丽媛 李伟 王鹏关键词:鼠疫疫源地 实时荧光定量PCR检测布鲁菌的应用研究 被引量:5 2019年 目的 建立一种能快速检测布鲁菌的实时荧光定量PCR(RT-PCR)初步筛查方法。 方法 根据编码布鲁菌外膜蛋白omp10和omp31的碱基序列设计4对引物和对应探针,即omp10、omp10-1、omp31和omp31-1,应用实时荧光定量PCR技术,将设计的引物和探针分别用于检测6个种类的19份已知生物型的标准布鲁菌株DNA、10份云南玉溪分离的布鲁菌株DNA和224份阴性对照菌株DNA,包括35份巴尔通体菌、103份小肠结肠炎耶尔森菌(其中包括4份O∶3型和9份O∶9型)和86份杂菌,根据检测结果评价引物和探针的特异性。 结果 omp10、omp10-1可对19种标准布鲁菌株DNA进行扩增,omp10的起峰时间和扩增曲线优于omp10-1,且omp10不能扩增阴性布鲁菌株的DNA;omp31-1可对16种标准布鲁菌株DNA进行扩增;omp31不能扩增标准布鲁菌株DNA。omp10、omp10-1和omp31-1检测10份玉溪分离的布鲁菌株,DNA的平均循环(Ct)值分别为:19.87,、19.14、17.52。 结论 omp10特异性强,只对布鲁菌有特异性扩增,可用于布鲁菌的快速检测。 杜清春 王鹏 董珊珊 姜海 丁奕博 杨向东关键词:RT-PCR 特异性 检测鼠疫抗体胶体金免疫层析试纸条的研制 被引量:5 2006年 目的建立快速、简易的检测鼠疫F1抗体的胶体金免疫层析法(G ICA)。方法(1)采用胶体金颗粒标记纯化F1抗原,并将标记物喷于玻璃纤维;同时将纯化F1抗原喷线固定于硝酸纤维素膜上,用于F1抗体的捕捉;按常规组装成检测鼠疫抗体免疫层析试纸条。(2)采用该试纸条与血凝法对同一份兔抗F1抗体进行检测,以评价该试纸条的敏感性。(3)采用该试纸条对44株非鼠疫菌的免疫鼠血清进行检测,以评价该试纸条的特异性。(4)采用该试纸条、血凝法及ELISA对607份血清标本进行检测,以评价该试纸条对现场材料的检测效果。结果(1)该试纸条可在15 m in之内完成检测;(2)在敏感性上,该试纸条对同一份免疫兔血清的检测较血凝法高一个滴度;(3)对被试的44株所选菌株的免疫鼠血清的检测均为阴性;(4)在对607份血清标本的检测中,免疫层析试纸条、血凝及ELISA三种方法的符合率中度,而免疫层析试纸条的敏感性分别比血凝与ELISA高111%和90%。结论以纯化的鼠疫F1抗原为基础建立的G ICA检测鼠疫F1抗体的方法特异性强、灵敏度高、简便快速,无需特殊仪器设备,有较大的推广应用价值。 王鹏 石丽媛 郭英 杜春红 尹家祥 黄鹏 钟佑宏 董珊珊 吴明寿 于国林关键词:鼠疫 F1抗体 caf1基因为靶标的鼠疫检测PCR法的改进 被引量:8 2018年 目的查明行业标准推荐caf1基因引物(简称行标caf1引物)进行PCR检测时,在一些非鼠疫菌上出现非特异性条带的原因,并提出解决办法。方法共选取112株菌进行试验,其中鼠疫菌40株、非鼠疫菌72株;提取菌株DNA,并对caf1基因进行PCR扩增;选择出现非特异性条带的7株菌株,进行切胶回收、纯化以及TA克隆测序;针对caf1基因重新设计引物,对被试菌株进行验证。结果使用行标caf1引物扩增40株鼠疫菌,均未出现非特异性条带,扩增72株非鼠疫菌,有58株扩增出400、500、600、700、800、900、1 000 bp的非特异性条带。经克隆和测序,在非特异性产物的基因序列中均出现行标caf1引物的反向引物序列及反向引物的反向互补序列。重新设计caf1引物,扩增72株非鼠疫菌,均未出现非特异性条带。结论行标caf1引物在筛查鼠疫菌时会出现非特异性条带,使用新caf1引物可有效避免这一情况,提高检测的准确性。 张艳 郭英 董珊珊 揭云翠 钟佑宏 李伟 宋志忠 王鹏关键词:聚合酶链式反应 分子生物学方法鉴定由自毙鼠分离的细菌 2014年 目的对1株由自毙鼠分离的细菌(X175菌株)进行属、种及型的鉴定。方法 1采用16S rDNA对X175菌株进行种属鉴定;2应用荧光PCR检测X175菌株是否存在致泻性大肠埃希菌常见毒素基因(stx1/stx2/eae、lt/st、aggR/ipaH)及大肠埃希菌O104、H4基因;3应用PCR检测X175菌株是否存在肠出血性大肠埃希菌(EHEC)O104∶H4的9个毒力基因。结果 1经16S rDNA鉴定,X175菌株与大肠埃希菌埃希菌属的一些菌株相似度达99%,进化树显示X175菌株与大肠埃希菌O104∶H4菌株的亲缘关系较近;2大肠埃希菌O104基因和ipaH基因检测结果均为阳性,stx1/stx2/eae、lt/st、aggR、志贺菌/沙门菌、H4等基因检测结果均为阴性;3肠出血性大肠埃希菌O104∶H4九个毒力因子检测结果均为阴性。结论X175菌株为大肠埃希菌O104弱毒型菌株,H抗原和其他一些特性还需进一步研究。 郭英 陈双艳 石丽媛 董珊珊 王鹏关键词:大肠埃希菌 RDNA 毒力基因 鼠疫菌纤溶酶原激活因子的分离纯化 2009年 目的建立从人工培养的鼠疫菌中分离和纯化纤溶酶原激活因子(Plasminogen activator,Pla)的方法。方法分别用超声破碎、尿素提取与硫酸铵盐析相结合的方法(简称超声法、尿素法)提取Pla,并分别用离子交换、凝胶过滤两步层析相结合的高效液相色谱和制备电泳纯化Pla,对提取、纯化的Pla进行纤溶酶原激活剂活性检测。结果鼠疫菌超声破碎上清50%~60%饱和硫酸铵沉淀和尿素浸渍菌粉上清0~10%饱和硫酸铵沉淀,均获得了3条蛋白带[相对分子质量(Mr)约31×10^3、35×10^3、37×10^3]。纤溶酶原激活剂活性检测两种方法获得蛋白的溶圈直径分别为6.5、7.2mm。用高效液相色谱纯化的Pla主要由Mr约31×10^3、35×10^3、37×10^3的3条蛋白带组成,纤溶酶原激活剂活性检测溶圈直径为5.0mm。制备电泳纯化的Pla主要由Mr约31×10^3、35×10^3、37×10^3的3条蛋白带组成,条带所在位置还有其他一些低浓度蛋白存在,纤溶酶原激活剂活性检测无溶圈出现。结论超声法和尿素法可以提取到Pla,后者经高效液相色谱和制备电泳可以达到基本纯化。 石丽媛 于国林 白丽 杨光璨 董珊珊关键词:耶尔森菌 鼠疫 纤溶酶原激活剂 云南省不同型鼠疫自然疫源地鼠疫菌生化特性比较 被引量:5 2009年 目的通过对云南省不同流行地区、宿主、媒介分离出的鼠疫菌生化特性及毒力因子PstⅠ的鉴定结果,比较云南省家、野鼠型鼠疫自然疫源地及新发现玉龙县鼠疫疫源地鼠疫菌生化特性的差别及疫源地相互之间的联系。方法采用资料回顾方法,收集用试管法鉴定的云南省218株鼠疫菌生化特性(酵解鼠李糖、甘油、麦芽糖、阿胶糖、密二糖)和毒力因子PstⅠ的结果,利用SAS8.0统计软件进行汇总,采用双向无序RxC表X^2检验的Fisher确切概率法对鉴定结果进行分析。结果收集野鼠型鼠疫疫源地鼠疫菌48株,其中有1株发酵麦芽糖,48株均发酵甘油;收集家鼠型鼠疫疫源地鼠疫菌165株,其中有1株不发酵麦芽糖、发酵甘油,1株脱氮阴性,属变异菌株;收集玉龙县新分离鼠疫菌5株,均发酵甘油、麦芽糖。对不同疫源地鼠疫菌麦芽糖、甘油发酵试验结果进行比较,差异有统计学意义(P〈0.01);对鼠疫菌鼠李糖、阿胶糖、密二糖发酵试验和毒力因子PstⅠ进行比较,差异无统计学意义(P〉0.01)。结论云南省不同型鼠疫自然疫源地鼠疫菌生化特性不同,其中家、野鼠型疫源地鼠疫菌生化特性有交串现象;玉龙县鼠疫菌生化特性与家、野鼠型疫源地鼠疫菌截然不同,与西藏北部旱獭鼠疫菌的生化特性接近。 郭英 韦蝶心 梁云 苏鹏 杨智明 董珊珊 钟佑宏 宋志忠关键词:糖酵解 甘油 一种生物安全柜实验操作专用垫 本实用新型涉及一种生物安全柜实验操作专用垫,其特征在于:包括垫子,所述垫子分三层,最上层是亲水层,中间层是吸水层,底层是防水层。本实用新型的垫子用于生物安全柜实验操作,能够接住生物安全柜中微生物溢出、泼洒有毒有害微生物,... 王鹏 钟佑宏 石丽媛 董珊珊 段存娟 张海鹏文献传递 一种高通量筛选噬菌体宿主谱的方法 本发明公开一种高通量筛选噬菌体宿主谱的方法,属于噬菌体宿主谱筛选技术领域。本发明所述方法为经纯化后的噬菌体进行复壮,使效价达10<Sup>6</Sup>以上;宿主菌经适宜温度气浴振荡培养至对数生长期备用;在96孔微量培养... 钟佑宏 王鹏 杨丽华 石丽媛 董珊珊 张海鹏 谭红丽文献传递 鼠疫菌纤溶酶原激活因子Pla的提取与纯化方法 本发明涉及一种鼠疫菌纤溶酶原激活因子Pla的提取与纯化方法,该方法包括:将鼠疫菌体经溶菌酶处理,然后经超声破碎,再进行硫酸铵盐析,得到粗提Pla蛋白;粗提Pla蛋白采用羟基磷灰石层析柱进行层析纯化,其中在上样缓冲液中加入... 宋志忠 杜春红 石丽媛 王鹏 杨光璨 钟佑宏 董珊珊文献传递