陈淑红
所属机构: 黑龙江省疾病预防控制中心 所在地区: 黑龙江省 哈尔滨市 研究方向: 医药卫生 发文基金: 国家科技重大专项
相关作者
李冀宏 作品数:41 被引量:142 H指数:8 供职机构:黑龙江省疾病预防控制中心 研究主题:肾综合征出血热 汉坦病毒 手足口病 S基因 疫情分析 陈露菲 作品数:40 被引量:144 H指数:7 供职机构:黑龙江省疾病预防控制中心 研究主题:肾综合征出血热 汉坦病毒 流行性出血热 手足口病 森林脑炎 杨明 作品数:30 被引量:176 H指数:8 供职机构:黑龙江省疾病预防控制中心 研究主题:肾综合征出血热 流感 监测分析 发热 S基因 胡泉博 作品数:14 被引量:68 H指数:6 供职机构:黑龙江省疾病预防控制中心 研究主题:肾综合征出血热 宿主动物 肾综合征出血热患者 疫情分析 出疹 华华 作品数:25 被引量:127 H指数:7 供职机构:黑龙江省疾病预防控制中心 研究主题:肾综合征出血热 监测分析 流感 发热 肾综合征出血热患者
2015~2018年柯萨奇病毒A组6型在黑龙江省的持续流行 被引量:11 2020年 手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是一类常见的儿童传染病,自2009年以来,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)已经成为引起HFMD流行持续循环的重要病原之一,是其他肠道病毒(Enterovirus,EV)中的优势病原,而黑龙江省CV-A6相关研究报道尚欠缺。本研究为了解2015~2018年黑龙江省HFMD流行概况和病原学组成,并分析该地区CV-A6的基因特征,收集2015~2018年黑龙江省HFMD疫情资料进行流行病学分析,并采集HFMD病例临床标本进行EV核酸检测。对分离出的EV毒株进行CV-A6的特异性荧光定量PCR法检测,对所有CV-A6阳性毒株进行全长VP1区扩增和核苷酸序列测定,并与GenBank上下载的CV-A6分型代表株构建系统进化树,以了解CV-A6的基因特征。流行病学结果显示,2015~2018年黑龙江省HFMD疫情平稳且2017年有所下降,无死亡病例。黑龙江省每年7月~8月为HFMD流行高峰,患病人群平均年龄为(4.39±3.74)岁,男女患病比例为1.44∶1。全省13个地市均收集到标本,哈尔滨市标本数最多,占36.77%。2015~2018年在黑龙江省共分离到69株CV-A6,与CV-A6原型株的核苷酸相似性为81.8%~83.9%,氨基酸相似性为94.0%~96.3%,均属D3基因亚型的D3a进化分支。尽管肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)和CV-A16为主要病原,但D3基因亚型的CV-A6也已成为引起黑龙江省HFMD流行的稳定型别之一,且有加强的趋势,因此应加强CV-A6疫情的监控和分析,为该地区HFMD防控及疫苗研制提供基础数据。 张曼 陈淑红 陈淑红 张勇 张勇 宋洋 许军 孙巍 杨明 路环环 许文波 刘志军 许文波肾综合征出血热汉坦病毒分型及序列特征的研究 被引量:4 2014年 目的 分析黑龙江省肾综合征出血热(HFRS)患者携带汉坦病毒的基因型别及序列特征.方法 采集临床诊断为肾综合征出血热病人的全血60例,其中通过金标法检测出血热特异性抗体阳性40例、阴性20例,血凝块提取汉坦病毒RNA,应用RT-Nest-PCR及核苷酸序列测定分型技术对黑龙江地区的汉坦病毒进行分型研究,设计汉坦病毒M片段通用引物(MOF,MOR)及HTNV和SEOV的M片段特异性引物(HTNMF、HTNMR,SEOMF、SEOMR),应用Nest-PCR进行扩增,回收阳性扩增产物进行基因序列测定,将所测基因序列与国内外HV病毒株序列进行核苷酸同源性分析,构建M基因种系进化树.结果 出血热特异性抗体阳性的病例中扩增出HTN型19份,抗体阴性的病例中扩增出HTN型1份、SEO型l份.总体来看黑龙江省流行的汉坦病毒毒株主要为HTN型和SEO型,以HTN型为主.经核苷酸及氨基酸同源性和种系进化分析表明其黑龙江地区的病毒株同源性较高,其中HTN型与76 ~ 118株同源性较高,SEO型与Z37株的同源性较高.结论 黑龙江省的HV感染病例多为HTN型,与其他GenBank中的各地标准株的核苷酸及推导的氨基酸序列均有一定差异,在系统进化树中分析HTN型与76-118株较为接近.SEO型与国内Z37较为接近.结合临床症状发现其临床症状较为相似的在系统进化发生树中较为接近. 盛欣 陈淑红 兰英华 陈国林 郭伟 王开利 李用国关键词:肾综合征出血热 汉坦病毒 M基因 黑龙江省肾综合征出血热患者汉坦病毒分离及分子特征 2018年 目的研究黑龙江省肾综合征出血热(HFRS)患者感染汉坦病毒(HV)的分子特征及其与鼠携带HV的对应关系。方法从HFRS患者血标本中成功分离到一株HV,编号WCL,对病毒S基因进行扩增和序列分析。结果WCL株S基因全长由1698 nt组成,TA含量丰富,编码N蛋白的ORF起始于37nt,终止于1326 nt,编码的蛋白长429 aa,符合HTN型编码。与HV参考毒株进行比较,WCL与汉滩型(HTN)同源性较高,尤其与黑龙江省黑线姬鼠分离株Bao14同源性最高,与汉城型(SEO)等其他病毒同源性较低,并且WCL的S基因编码的N蛋白氨基酸序列也比较保守。进化树分析表明,WCL位于HTN型病毒所在支系,与Bao14、HTN261处于同一分支并且更接近,同属于H4亚型,体现了一定的地理簇集性。结论 WCL与黑龙江省黑线姬鼠分离株属同一亚型,首次发现有H4亚型病例分布。 陈淑红 华华 孙巍 胡泉博 杨明 李冀宏关键词:肾综合征出血热 汉坦病毒 S基因 同源性 2017—2022年黑龙江省肾综合征出血热流行特征及空间聚集性分析 2024年 目的了解黑龙江省肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)的三间分布特点、空间聚集性,为HFRS疾病监测和防控工作提供参考依据。方法HFRS病例数据信息来源于中国疾病预防控制中心“传染病报告信息管理系统”,应用空间自相关分析的方法对2017年1月1日—2022年12月31日的HFRS监测数据进行分析,在流行病学三间分布、空间聚集特征上进行描述。结果2017—2022年黑龙江省共报告HFRS病例5855例,2017—2019年发病率呈现上升趋势,之后逐年下降;41~50岁年龄组病例数最多,2021年以后51~60岁男性病例占比增加,居各年龄组首位。60岁以上人群发病比例达到20%以上,男性病例数高于女性病例数(χ^(2)=143.76,P<0.01),在职业分布上农民占绝对优势,全年12月均有病例报告,有春夏、秋冬两个发病高峰;全局空间自相关分析显示,在县区水平(除2018年外)发病呈现空间自相关性(Moran’sΙ>0,P<0.05),提示HFRS发病(除2018年外)在地理区域上存在聚集性。通过局部空间自相关分析得出:2017—2022年“高-高”聚集区的数量呈现下降趋势,在整体上“高-高”聚集区域有从东北向东南再向西南移动的趋势。在死亡病例中90.63%感染了SEO型HFRS,均未接种疫苗,发病到诊断时间差的中位数大于非死亡病例发病到诊断时间差的中位数。结论2017—2022年黑龙江省HFRS总体呈现平稳下降的趋势,但发病仍排在全国前列,应继续在全省高发聚集县区的重点人群中加强健康教育和HFRS疫苗接种等防控措施,对“高-低”“低-高”聚集模式县区的病例进行数据质量核查,分析出现这一模式的原因。应在SEO型HFRS流行区域提高疫苗覆盖率和就诊意识。 华华 胡泉博 陈淑红 田育文关键词:肾综合征出血热 黑龙江省肾综合征出血热病毒基因序列变化特点 2019年 目的研究黑龙江省肾综合征出血热病毒基因序列特点,以期寻找近年来黑龙江省肾综合征出血热临床特点变化的原因。方法收集鼠肺标本110例及2005—2015年就诊于哈尔滨医科大学附属第一医院及齐齐哈尔市第七医院临床诊断为轻型和不典型肾综合征出血热的患者早期血标本121例,及部分典型出血热患者外周血标本100例,提取病毒核酸,进行序列扩增,电泳分析及基因测序,所得序列分型并与既往毒株基因序列进行比较,进行系统进化及同源性分析,结合核苷酸及氨基酸位点的变化,探讨肾综合征出血热临床特点变化原因。结果轻型及不典型肾综合征出血热基因序列扩增成功26例,其中HTN型14例,SEO型12例。典型肾综合征出血热标本扩增成功22例,其中HTN型19例,SEO型3例;黑龙江省人源与鼠源汉坦病毒与76-118株均存在变异,非典型病例标本、典型病例标本、鼠源汉坦病毒与标准株核苷酸同源性分别为74.4%~89.2%、87.4%~90.3%、88.1%~88.5%;人源及鼠源汉坦病毒同源性为79.7~99.1%,其中人源的Hljh38、Hljh39与其他毒株差异较大,与既往Amur病毒株H5、H8205同源性高,可达94.9%~97.6%,为同一亚型。推导的氨基酸与标准毒株比较部分位点存在变异,但未见明显的变异规律。结论黑龙江省肾综合征出血热临床特征较之前发生变化的原因与病毒型别的变化相关;同时也存在汉坦病毒变异,氨基酸位点变化,但具体变异规律及与临床表现的相关性有待进一步验证。 赵越 沈颖 朱可佳 陈淑红 盛欣 兰英华关键词:肾综合征出血热 病毒变异 基因测序 系统进化树 BP神经网络在肾综合征出血热发病率预测中的应用 被引量:8 2012年 目的探讨BP(back propagation)神经网络预测模型在肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)发病率预测方面的应用效果。方法应用人工神经网络技术建立关于疾病发病率的预测模型。结果建立了拓扑结构为2-10-1的BP神经网络模型,并对预测效果进行了验证。结论 BP神经网络预测模型可用于HFRS发病率的预测,且具有较好的预测效果。 杨佳琦 陈露菲 陈淑红 邵冰 曹博 李航 焦喆 高函璐 王滨有关键词:肾综合征出血热 发病率 大白鼠中汉坦病毒的分子特征分析 2018年 目的了解实验用大白鼠感染汉坦病毒(HV)的型别和分子特征,为研究肾综合征出血热(HFRS)宿主动物携带HV类型提供依据。方法随机抽取50只实验用大白鼠,取鼠肺,经免疫荧光检测发现有一份鼠肺HV抗原阳性,进行病毒分离和RT-PCR初步分型鉴定之后,对病毒S基因进行扩增和序列分析。结果从实验用大白鼠中成功分离到一株HV,编号DB08028,其S基因全长1777 nt,TA含量丰富,编码N蛋白的ORF起始于43 nt,终止于1332 nt,编码的蛋白长429 aa,符合SEO型编码。S基因同源性分析表明,DB08028与汉城型(SEO)同源性较高,与汉滩型(HTN)等其他病毒同源性较低,其中与Bj HD01的同源性最高,与黑龙江早年褐家鼠分离株SC106和pf26的同源性也相对较高,N蛋白氨基酸序列比较保守。进化树分析表明,DB08028位于SEO型病毒所在支系,与Bj HD01最接近,其次是黑龙江省褐家鼠分离株SC106和pf26,体现了一定的宿主依赖性和地理簇集性。结论实验用大白鼠携带SEO型HV,与黑龙江省褐家鼠携带的HV属同一型别,是不可忽视的传染源。 陈淑红 胡泉博 华华 杨明 周广恩 李冀宏关键词:大白鼠 汉坦病毒 S基因 褐家鼠汉坦病毒黑龙江SC106分离株S基因特征分析 被引量:6 2010年 为研究家鼠型(SEO)汉坦病毒(HV)黑龙江分离株的分子特征,本研究对黑龙江省SEO型新分离株SC106的S基因进行了扩增和序列分析。结果表明:SC106株S基因全长由1775nt组成,编码的蛋白长429aa,符合SEO型编码。与HV参考毒株进行比较,SC106与SEO型同源性最高,与姬鼠型(HTN)相对较低,与其它型别同源性更低。N蛋白进化树分析表明,SC106位于SEO型病毒所在支系,与河南株R22,黑龙江株Pf26和北京株BjHD01亲缘关系接近,体现了一定的宿主依赖性和地理簇集性。序列分析表明:SC106与黑龙江省首个SEO型分离株Pf26均为SEO型中的S1亚型,它们的S基因核苷酸序列同源性也最高(99.2%),并且SC106的S基因编码的N蛋白氨基酸序列也比较保守,由此证实,HV的进化与时间关系不大。 陈淑红 彭永刚 陈露菲 刘娣 刘娣 刘彦成 杨明 王开利 张静关键词:褐家鼠 汉坦病毒 S基因 黑龙江省2015—2016年发热伴出疹症候群流行特征及病原学分析 被引量:8 2020年 目的研究2015—2016年黑龙江省发热伴出疹症候群病原谱及流行规律,为黑龙江省发热伴出疹性疾病的预防控制提供科学依据。方法 2015—2016年对217份标本应用实时荧光定量PCR方法进行肠道病毒、水痘-带状疱疹病毒、风疹病毒、麻疹病毒、人类小DNA病毒B19的病原学检测;采用Fisher确切概率法进行统计分析。结果对217份标本进行检测,其中咽拭161份,肛拭3份,疱疹液53份;病毒核酸阳性结果176份,阳性率81.10%,其中EV-A71阳性1份,阳性率0.46%;CV-A16阳性22份,阳性率10.13%;PE阳性8份,阳性率0.45%;CV-A6阳性57份,阳性率32.38%;CV-A10阳性1份,阳性率0.05%;水痘-带状疱疹阳性84份,阳性率47.72%;麻疹阳性3份,阳性率0.17%。男性检出率为76.98%,女性检出率为86.81%,检出率性别差异及各年龄组分布差异均无统计学意义。结论肠道病毒和水痘-带状疱疹病毒是黑龙江省发热伴出疹性疾病感染的重要病原体,加强肠道病毒和水痘病毒疫苗接种可对发热伴出疹性疾病的发病起到控制作用。 周广恩 华华 陈淑红 许军 胡泉博 李冀宏 杨明关键词:呼吸道传染病 病原学 黑龙江省2018年肾综合征出血热流行病学分析 被引量:8 2020年 目的分析黑龙江省肾综合征出血热(HFRS)流行特征,为疫情监测、防控提供参考。方法利用黑龙江省传染病报告信息管理系统收集2018年HFRS病例资料,用描述性流行病学方法进行统计分析。结果 2018年黑龙江省共报告1 249例HFRS患者,报告发病率为3.3/10万,死亡率为0.03/10万,为近3年来的最高水平。1 150例病例调查资料表明,全省13个地(市)均有病例,其中哈尔滨、佳木斯、黑河及齐齐哈尔等市报告数较多,各地不同年发病率差异无统计学意义(χ^2=1.231,P>0.05);秋冬季为发病高峰,病例相对集中在41~60岁年龄组人群;男女病例性别比为3∶1,发病率差异有统计学意义(χ^2=97.531,P<0.05);病例职业以农民为主,91%的病例从未接种过疫苗,81%的人有明确的接触史。结论黑龙江省HFRS疫情不容忽视,应加强重点人群的防护、疫苗接种、灭鼠和宣传教育等工作,确保重点人群的健康。 华华 杨明 陈淑红 胡泉博 李冀宏关键词:肾综合征出血热 流行病学调查 疫情分析