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猪轮状病毒G9P[7]型云南株的分离鉴定及VP4和VP7基因测序分析: 2024年; 为确定云南省某猪场仔猪腹泻的病原,对送检腹泻病仔猪小肠组织样品进行猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS-CoV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪丁型冠状病毒(PDCoV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(PoRV)RT-PCR检测,将PoRV检测阳性样品处理后接种至MA-104细胞进行PoRV分离;对分离毒株进行间接免疫荧光、电镜观察、胶体金检测和VP4、VP6、VP7基因测序及遗传进化分析。结果显示,仔猪肠道组织样品经终浓度20μg/mL的胰酶在37℃孵育2 h,能在MA-104细胞上增殖传代,第3代出现稳定的细胞病变,盲传20代,每隔5代进行PoRV的检测;间接免疫荧光试验可见特异性荧光,胶体金和RT-PCR检测均为PoRV阳性,电镜观察可见病毒粒子直径约为65 nm,呈车轮状,符合PoRV粒子典型形态特征,将该分离株命名为PoRV YN-A株。基因同源性比较和遗传进化树分析显示,YN-A株的VP6基因序列与国内A群GD株的同源性为99.93%,VP7与中国G9型NJ2012株的同源性为99.12%,VP4与美国P[7]型OSU株的同源性为98.91%,确定该分离株为猪A群轮状病毒G9P[7]型。YN-A株VP7序列在9个氨基酸位点存在点突变,即aa9(I→V)、aa16(V/T→I)、aa44(A→V)、aa100(D/E→N)、aa212(T/A→K)、aa221(N→S)、aa225(V→A)、aa271(I→V)、aa267(D→E)。首次从云南地区的腹泻仔猪小肠组织中成功分离到1株G9P[7]型的新基因型PoRV毒株,为PoRV的致病性、分子生物学特性研究及PoRV G9优势基因型新疫苗研发奠定了基础。; 王修武邓可辉马沐林关金连韩淑杰郭智轩孙守湖贺东生; 关键词：电镜观察

羊轮状病毒GS2023株VP7基因的克隆与序列分析: 2024年; 为研究羊轮状病毒(Rotavirus,RV)VP7基因的结构特点及功能,本试验扩增RV GS2023株VP7基因,并将其连接到pMD18-T载体上,通过生物信息学软件进行序列分析及功能预测。结果表明VP7基因全长978 bp,该蛋白分子质量为37.11763 ku,理论等电点为4.72,偏酸性;不稳定系数为35.29,属于稳定蛋白,不含信号肽。VP7蛋白是一种亲水性蛋白,含有62个糖基化位点和83个磷酸化位点,存在两个跨膜螺旋结构。VP7蛋白最有可能存在于质膜中,高尔基体、过氧物酶体、细胞外基质中也有分布。VP7蛋白的二级结构主要由α螺旋、延伸链、无规则卷曲组成,其中α螺旋占比为33.13%。GS2023株VP7与国内B11-R1株VP7基因相似性最高,为96.6%;GS2023株VP7与同型参考株的VP7氨基酸序列在多个位点有突变,但大部分氨基酸位点是保守的;GS2023株的VP7基因系统发育进化分析结果显示,与同型参考株聚为同一分支,且与B11-R1株亲缘关系最近。; 王天宇赵登率张远航李平于頔浠赵孟孟高寒覃丽梅郭利伟张克山; 关键词：VP7基因克隆遗传进化分析

一例猪轮状病毒的实验室诊断及VP7基因序列分析: 2024年; 为确定湖南省怀化市某规模化猪场仔猪腹泻原因,采用RT-PCR试验方法对病死仔猪肠道内容物及粪便进行流行性腹泻病毒、传染性胃肠炎病毒、轮状病毒检测,并对RT-PCR产物进行测序分析、同源性比对。结果表明,仔猪腹泻为轮状病毒感染引起,经序列分析发现该毒株与G9亚型毒株位于同一分支上,且同源性最高,为95.8%,因此判断此次引起仔猪发病为G9型猪轮状病毒感染所致,为当前省内流行毒株。; 唐慧伦欧阳璐李清竹欧云文; 关键词：仔猪腹泻轮状病毒 VP7基因

辽宁地区哺乳仔猪病毒性腹泻流行病学调查及轮状病毒VP7基因扩增和序列分析: 猪群腹泻一直是影响我国养猪行业健康发展的一类重要的疾病。尤其是病毒性因素引起的腹泻,能导致母猪生产性能和繁殖性能下降,育肥猪饲料报酬降低,产房仔猪和保育猪死淘率增加,尤其是7日龄以内的仔猪,死亡率可高达100%,给养猪场...; 张可; 关键词：哺乳仔猪腹泻流行病学调查 VP7基因

湖北地区猪A群轮状病毒的流行病学调查与VP7基因的遗传分析: 猪轮状病毒（PorcineRotavirus，PoRV）是养猪场仔猪发生病毒性腹泻的主要病原之一，可通过口鼻感染猪只，引发仔猪胃肠道病变，导致仔猪腹泻、呕吐、排水样粪便，A群为主要致病血清型。PoRV在猪场感染率可达45...; 张子微; 关键词：猪轮状病毒 VP7基因流行病学

人轮状病毒VP7基因分子生物学研究进展: 2022年; 轮状病毒是一种具有二十面体结构的大肠病毒群,被组装在直径为70nm的内质网中.轮状病毒的感染是导致婴儿病毒性腹泻的最常见原因.据统计,在发展中国家,每年由轮状病毒感染引起的肠胃炎和脱水的儿童人数在60万至80万之间.目前,当人或动物感染轮状病毒时,尚无有效的治疗方法,腹泻引起的体液失衡可暂时通过补充葡萄糖等来缓解,但这并不能从根本上消除病毒的危害.由于财务负担巨大,轮状病毒的中和抗原VP7对基因工程疫苗的开发尤为重要.随着时代的快速发展,研制出高效价的灭活疫苗来进行接种是从源头上控制轮状病毒感染和传播的有效手段.本文综述了人类轮状病毒VP7基因的研究进展.; 王红涛安俊羽秦玉蓉王美婷李江; 关键词：轮状病毒基因工程疫苗

2020~2021年福州地区市婴幼儿腹泻轮状病毒VP7基因的分子流行病学特征: 2022年; 目的了解2020~2021年福州市婴幼儿腹泻轮状病毒(RV)VP7基因的分子流行病学特征。方法选取2020年1月~2021年1月收集福建省福州儿童医院就诊的门诊或住院5岁以下患非细菌性急性腹泻的婴幼儿大便,先用胶体金法检测轮状病毒抗原,并经荧光定量qPCR(逆转录PCR)方法证实为轮状病毒,然后用巢式RT-PCR方法进行VP7(G)基因分型并分子特征分析。结果60份粪便标本中,30份检测到A组RVRNA基因,阳性率为50%。男19例,女11例;年龄6~37个月,平均11.9个月。对30份A组RV RNA阳性标本进行VP7基因型分型,其中G3型22例(73.33%),G1型4例(13.33%),G1和G3混合感染型3例(10.00%),G1与G9混合感染型1例(3.33%)。30例A组RV RNA阳性患儿中并呼吸道感染6例,其中G3型5例,G1和G3混合型1例。G1型Vesikari评分(14.6±5.6)分、腹泻病程(5.15±0.52)d均显著高于G3型,P<0.05;但两组呕吐持续时间、发热持续时间比较,P>0.05。结论2020~2021年福州地区急性腹泻婴幼儿A组RV以G3型为主要流行基因型,并发现混合型感染病例及不常见的G9型感染病例。; 郑欣欣陈智伟卓玲陈凤娇李东黄意坚林卫东; 关键词：急性腹泻婴幼儿轮状病毒分子流行病学

2018-2020年人轮状病毒锦州地方株VP4及VP7基因特征被引量：6: 2021年; 【背景】人A组轮状病毒(Rotavirus Group A,RVA)是婴幼儿胃肠炎的主要病原体及发展中国家婴幼儿死亡的重要原因,目前无特效药物治疗,疫苗预防是唯一可行的预防感染方法。外衣壳蛋白VP7和VP4是疫苗设计的主要靶点,针对该基因加强RVA地方株分子流行病学监测十分必要。【目的】对锦州地方流行RVA株VP7和VP4基因进行型别鉴定和序列特征分析。【方法】收集锦州地区2018-2020年RVA感染腹泻患儿的粪便标本,提取病毒RNA,通过RT-PCR扩增VP7、VP4基因片段并测序,得到7株RVA VP7和VP4序列。使用在线基因分型工具Rota C V2.0对测序结果进行分型分析。应用BLAST、DNAStar、MEGA X、Bio Edit等生物软件与临床流行株及疫苗株进行系统发育分析及氨基酸序列比对分析。【结果】分型结果表明7株锦州地方株均为G9P[8]型,系统发育分析证实其VP7和VP4基因分别属于G9-Ⅵ和P[8]-3谱系,核苷酸序列相似性分别为99.32%-100%与99.41%-100%。JZ株VP7与疫苗株Rotavac和Rotasiil相比,在抗原表位区7-1a、7-1b、7-2中分别存在4个和3个氨基酸替换。JZ株VP4与疫苗株Rotarix和Rota Teq VP4氨基酸序列相比,发现7个和4个氨基酸替换,位于抗原表位区8-1和8-3。【结论】2018-2020年在辽宁锦州地区检测到7株G9P[8]型RVA株,VP7和VP4序列相似性高于99%,G9P[8]型可能是辽宁省锦州地区2018-2020年婴幼儿轮状病毒腹泻的主要流行基因型之一。与同基因型疫苗株比较,位于JZ株VP7和VP4抗原表位区的氨基酸位点差异对于野毒株免疫逃逸机制的研究具有意义。; 康庚庚李慧李卫巍张瑛汀杨倩文王涵可卢颖; 关键词：系统进化分析

半巢式多重PCR法对A组轮状病毒VP7基因的分型: 2021年; 目的采用半巢式多重PCR法对A组轮状病毒(group A rotavirus,RVA)VP7基因进行分型。方法根据GenBank中RVA VP7基因5′端保守区设计合成多组基因分型引物,提取11个RVA代表流行毒株病毒的RNA,采用半巢式多重PCR方法进行RVA的VP7基因分型,使用BLAST在线软件与GenBank上相应VP7核苷酸序列比对。结果经琼脂糖凝胶电泳鉴定,11株RVA的多重PCR产物大小均与预期一致,能正确鉴别具有代表性的流行毒株VP7基因型[G1、G2、KN105(Wa-like G3)、To16-01(equine-like,DS-1-likeG3)、G4、G8、G9及G12];经BLAST在线软件比对,RVA病毒株VP7基因序列与设计的上游引物匹配,并与下游引物互补,引物特异性良好。结论利用设计的引物成功建立的半巢式多重PCR方法能正确识别RVA的VP7基因型。; 谷长维胡博; 关键词：轮状病毒引物设计

2016—2017年河北正定县、湖南湘潭县及浙江玉环市轮状病毒VP7基因的分子流行病学特征被引量：2: 2021年; 目的分析2016—2017年河北正定县、湖南湘潭县及浙江玉环市轮状病毒(rotavirus,RV)VP7基因的分子流行病学特征。方法收集2016—2017年上述3个地区RV感染者粪便样本,采用RT-PCR法扩增RV阳性样本的VP7基因片段,并进行测序分型。同时对VP7基因核苷酸序列进行同源性分析,并构建进化树,将核苷酸序列翻译为氨基酸序列,分析原型株及UK-人重配疫苗毒株与3个地区样本VP7氨基酸序列的差异。结果测序结果共有G1、G2、G3、G94种基因型,所占比例分别为5.1%(10/199)、21.6%(43/199)、6.0%(12/199)、67.3%(134/199),4种G基因型RV与相应原型株进化距离较远,核苷酸序列相似性分别为90.6%~91.9%、83.5%~94.0%、82.6%~97.2%、75.8%~89.8%,与原型株及UK-人重配疫苗毒株比较,4种G基因型RV可变区分别有15、12、17、32个氨基酸位点存在差异。结论同一时间不同地区RV的G基因型优势流行株不同,流行株G9的优势亚型也会随时间发生变化,应加强对病毒的流行病学监测。; 陈红李庆亮段凯石晨张东董犇白萱乔建徐葛林杨晓明高招李放军吕华坤周海松鄢廷栋施海云; 关键词：轮状病毒 VP7基因分子流行病学系统进化分析

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