搜索到2023篇“ 特征基因“的相关文章
肺腺癌中高增殖肿瘤亚群的鉴别及特征基因集与应用
本发明公开了肺腺癌中高增殖肿瘤亚群的鉴别及特征基因集与应用。本发明经过一系列质控、细胞过滤、反复降维、聚类、细胞鉴定、生物富集分析、拷贝数变异分析等,发现了肺腺癌组织中具有高度分裂增殖能力的“干性”肿瘤细胞亚群,即高增殖...
熊延路张晏宁梁嘉赫文苗苗孙盈王雪娇田娅慧
基于APT攻击的网络特征基因突变识别方法、设备及介质
本发明公开了一种基于APT攻击的网络特征基因突变识别方法、设备及介质,该识别方法包括:将采集到的网络流量进行拆解并获取聚合的会话数据;从所获取聚合的会话数据中提取网络行为特征,并生成网络行为基因;将获取的网络行为基因输入...
谢东蒋烈付从海贾锦辉闫玉龙石林王庭宇
一种基于分子进化选择压预测癌症特征基因的方法与装置
本发明提供了一种基于分子进化选择压预测癌症特征基因的方法与装置,其中该方法,包括:基于癌症体细胞突变数据对癌症基因组中每个基因的体细胞错义突变数量进行建模得到双组分混合模型;利用双组分混合模型完成人类基因数据中驱动组分和...
周展朱许诺赵文艺王偲琪
一种特发性肺纤维化浆细胞特征基因预后模型构建方法
本发明提供了一种特发性肺纤维化浆细胞特征基因预后模型构建方法,包括:进行单细胞转录组数据分析,进行组织水平转录组数据差异表达基因分析,进行免疫细胞浸润分析,进行加权基因共表达网络分析,进行浆细胞相关候选基因的筛选,进行浆...
卢文菊林范杰张子丽
一种基于分子进化选择压预测癌症特征基因的方法与装置
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周展朱许诺赵文艺王偲琪
基于微血管侵犯特征基因的早期肝癌预后标志物、机器学习模型及其应用
本发明公开了基于微血管侵犯特征基因的早期肝癌预后标志物、机器学习模型及其应用,涉及肝癌早期诊断或预后的生物标记物技术领域,其技术要点为:本发明提供了一种基于微血管侵犯(MVI)特征基因预测早期肝癌预后的模型和五个潜在的早...
何志颖母晓兰蔡永超潘丽丽王喜城
基于加权基因共表达网络分析和机器学习筛选脓毒症免疫抑制特征基因及其靶向中药活性成分预测
2024年
目的本研究通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)和多种机器学习方法识别脓毒症免疫抑制特征基因,并预测其靶向中药活性成分。方法从美国国家生物技术信息中心基因表达综合数据库中下载GSE182522数据集,使用Bioconductor的“limma”软件包提取出差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行京都基因基因组百科全书(Kyoto encyclopediaofgenesandgenomes,KEGG)通路和基因本体论(geneontology,GO)富集分析,同时采用WGCNA,以及最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归、支持向量机递归特征消除(support vector machine-recursive feature elimination,SVM-RFE)、弹性网络回归分析3种机器学习法筛选出脓毒症免疫抑制特征基因。随后,构建受试者操作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC curve,简称ROC曲线)验证特征基因的诊断效能,并绘制箱线图展示特征基因的表达模式。选取SPF级BALB/c小鼠39只,采用随机数字表法将小鼠随机分为脓毒症免疫正常组(n=20)和脓毒症免疫抑制组(n=19)。盲肠结扎穿孔术构建脓毒症小鼠模型,在术后12h取脓毒症免疫正常组小鼠的外周血,术后24 h取脓毒症免疫抑制组小鼠的外周血。采用逆转录定量聚合酶链反应(reverse transcription quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)检测两组小鼠TRBV7-2的表达情况,验证TRBV7-2的诊断效能。最后,通过分子对接技术预测特征基因潜在靶点中药活性成分。结果共筛选出445个DEGs,其中上调基因173个,下调基因272个。DEGs主要富集于氮代谢、胆汁分泌、胃酸分泌3条信号通路,分子功能的正调控、细胞对含氧化合物的反应、细胞对含氮化合物的反应、对肽的响应、葡萄糖输入的调控等生物过程,质膜蛋白复合体、T细胞受体复合物、细胞侧膜等细胞组分,核苷三磷酸酶调节活性
林文杰吴慧萍
关键词:脓毒症免疫抑制特征基因
一种基于可解释深度学习的测序数据特征基因提取方法
一种基于可解释深度学习的测序数据特征基因提取方法,本方法使用可解释深度学习在分类决策过程中对决策起重要作用的特征基因进行提取,使用基因作为输入,对于目标细胞/spot(空间转录组中的测量单位)类型进行分类任务。并且在分类...
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预测铜绿假单胞菌碳青霉烯类药物药敏表型的特征基因
本申请属于生物信息学技术领域,具体涉及一种铜绿假单胞菌‑碳青霉烯类药物药敏表型耐药特征筛选方法,以及筛选到的用于预测铜绿假单胞菌‑碳青霉烯类药物药敏表型的特征基因组合、试剂盒及其应用,可准确预测药敏表型。
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预测铜绿假单胞菌碳青霉烯类药物药敏表型的特征基因、试剂盒及应用
本申请属于生物信息学技术领域,具体涉及一种铜绿假单胞菌‑碳青霉烯类药物药敏表型耐药特征筛选方法,以及筛选到的用于预测铜绿假单胞菌‑碳青霉烯类药物药敏表型的特征基因组合、试剂盒及其应用,可准确预测药敏表型。
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