公共文化服务平台

搜索到9529篇“ 测序技术“的相关文章

基于三代测序技术的靶向RNA测序方法及系统: 本发明公开基于三代测序技术的靶向RNA测序方法及系统。本发明的测序方法包括在去除核糖体RNA的总RNA样本中，利用多路反转录法取得全转录组的全长cDNA；将全转录组的全长cDNA片段进行环化和滚环扩增，并根据片段大小筛选...; 赵方庆张金阳左振强

一种基于高通量测序技术的外源性病毒污染检测方法及其应用: 本发明公开了一种基于高通量测序技术的外源性病毒污染检测方法及其应用。所述检测方法包括：取待检测细胞，进行第一培养，取第一培养过程中细胞进行裂解，剩余细胞继续培养，收集裂解细胞上清并接种于贴壁指示细胞进行第二培养，取第一培...; 贾雪卿龚圆昊秦冲韩婷沈施佳董元舒童涌

一种基于高通量的单细胞分泌物测序技术的解码分析方法: 一种基于高通量的单细胞分泌物测序技术的解码分析方法，可将单细胞水平的下机测序数据转化细胞分泌物表达矩阵以供下游进一步生信解析。测序结果解码流程本质上分为条码提取、比对校准、质控定量、种群分离计算和分泌物谱图构建。条码提取...; 杨朝勇郭烨刘卫枝

高通量测序技术对杀菌型益生菌含乳饮料菌群结构分析: 2024年; 目的分析杀菌型益生菌含乳饮料中菌群组成结构,并探究宣称添加益生菌的真实性和合规性。方法本研究以高通量测序技术为基础,从市售11批次杀菌型益生菌含乳饮料中全基因组提取,进行V3/V4变异区序列的聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增后,整理及统计样品测序序列数目,操作分类单元(operational taxonomic unit,OUT)归类,生成稀释曲线、Alpha多样性、聚类、丰度分布曲线与分析菌群结构和菌种标示合规性。结果共得到39231条优质序列,分布在210~518 bp范围内;共注解到16个门、37个纲、71个目、129个科、265个属;从门分类水平主要为厚壁菌门(Firmicutes 91.66%),从纲的分类水平主要为芽孢杆菌纲(Bacill 90.43%),从目的分类水平主要为乳杆菌目(Lactobacillales 82.74%);优势菌种为德氏乳杆菌保加利亚亚种、嗜热链球菌;同时产品有检出携带致病性非益生菌菌群。11种产品标签标示与实际检测到菌株完全一致的仅有1批次。结论本研究建立的高通量测序技术能准确、快速地探究杀菌型益生菌含乳饮料中微生物菌群多样性和潜在的致病性,市售产品益生菌种类丰富,但同质化程度较高,产品间菌群分布均匀度差异大。; 俞漪庄孝飞; 关键词：益生菌高通量测序技术菌群结构

基于高通量测序技术对不同地区米酒曲微生物群落结构的分析: 2024年; 采用高通量测序技术对湖北宜昌当地传统米酒曲与广西玉林传统米酒曲中的微生物群落结构进行解析,获得了酒曲中主要微生物种属和占比。结果表明,广西米酒曲在物种丰富度以及群落多样性上均高于宜昌米酒曲;广西米酒曲中优势真菌属以根霉属(Rhizopus)、毛霉属(Mucor)、毕赤酵母属(Pichia)和假丝酵母属(Candida)为主,宜昌米酒曲中根霉属(Rhizopus)和毛霉属(Mucor)为优势菌属;在细菌属水平上,广西米酒曲以片球菌属(Pediococcus)、假单胞菌属(Pseudomonas)、魏斯氏属(Weissella)、乳杆菌属(Lactobacillus)为主,宜昌米酒曲优势菌属为假单胞菌属(Pseudomonas)和魏斯氏属(Weissella);ASV/OTU韦恩图分析表明宜昌酒曲在物种独特性上要优于广西玉林酒曲。本研究揭示了宜昌传统米酒曲中的真菌与玉林传统米酒曲真菌菌种的差别,为逐步改善传统酒曲质量,以及相关微生物的进一步利用提供了理论指导依据。; 罗莉甘晋铭向亮亮毛文定谭爱华徐丹艺李方桥; 关键词：高通量测序技术

纳米孔三代测序技术在禽流感病毒全基因组测序中的应用: 2024年; 纳米孔(Nanopore)测序技术是一项新兴三代测序技术,具有巨大应用前景,然而在动物病原领域中的应用还处于起步阶段。为探究该技术在禽流感病毒(AIV)全基因组测序中的应用,本研究对采自农贸市场的2份AIV阳性鸡咽喉拭子样品(分别命名为AIV1和AIV2)进行RNA提取,利用AIV通用引物靶向扩增其全基因组,扩增产物经末端修复、3'末端加A碱基、条形码连接和添加测序接头等步骤,完成测序文库制备。经GridION×5Mk1测序仪测序获得7.16G数据,所获得的测序数据经数据质控、过滤去除低质量reads、比对拼接得到AIV全基因组序列,整个试验流程在13 h内完成。同时,采用一代测序方法验证Nanopore测序结果的准确性。测序数据质控结果显示所有读长(reads)的质量分数均大于10,AIV1产生404474条reads,平均reads为996.7 bp,平均reads质量分数为13.8,AIV2产生76589条reads,平均reads质量分数为13.5,平均reads为1095 bp,表明测序数据质量较高;利用Samtools软件统计AIV 8个基因节段的覆盖率和各基因节段位点的测序深度,结果显示AIV1全基因组的覆盖率达100%,平均测序深度为34473×,AIV2全基因组的覆盖率达100%,平均测序深度为7470×,表明拼接结果可靠性高;所得测序结果与一代测序结果通过Geneious Prime软件对比,结果显示,二者的一致性达98.78%~100%,其中AIV1有7个基因节段测序结果的一致性为100%,AIV2有5个基因节段测序结果的一致性为100%,一致性最低的MP基因的一致性也达98.78%,表明本研究的测序方法准确性良好。本研究成功实现Nanopore三代测序技术在AIV全基因组测序中的应用,通过优化扩增条件和数据处理为AIV全基因组的测序提供了一种新方法,在新发突发禽流感疫情应急检测中将发挥重要作用。; 吴炜姿周扬徐成刚瞿孝云王福广吴立炀叶健许秀琼钟文霞卢受昇; 关键词：禽流感病毒全基因组测序

高通量测序技术在低频突变检测中的应用被引量：1: 2024年; 体细胞突变的累积与衰老、肿瘤及多种疾病的发生密切相关。在正常组织细胞中,基因组中自发突变和诱发突变的变异等位基因频率极低,对这类低频突变的检测一直面临挑战。第二代和第三代高通量测序(next-generation sequencing,NGS)技术的出现,可以实现任意物种全基因组上变异的直接检测,克服传统突变检测技术的诸多局限性。但是常规NGS由于测序错误率较高从而限制了其在低频突变检测上的应用,基于分子一致性测序策略进行错误矫正的高准确性NGS测序技术作为有效的低频突变检测工具,有望在环境诱变剂的评价与研究、细胞与基因治疗药物风险评估、人群健康风险监测和生命科学基础研究领域发挥重要作用。本文对比经典突变检测方法,对基于NGS的低频突变检测技术研究进展进行综述,并对应用前景进行展望,以期为该技术的进一步开发、研究和在相关领域的应用提供参考。; 栾洋尤馨悦杨劲; 关键词：高通量测序技术致突变

一种RNA-seq测序技术检测未知病原体的方法: 本发明公开了一种RNA‑seq测序技术检测未知病原体的方法，属于生物技术领域。本发明通过首先直接对未知病原体标本的RNA进行高通量测序，然后对测序数据进行微生物种类生物信息学分析，通过RNA‑seq测序结合生物信息学分析...; 栾明春薄志坚王越郎兴莹王欢滕雪周林

一种利用16S rRNA基因测序技术检测里岔黑猪肠道菌群辅助育种的方法: 本发明提供了一种利用16S rRNA基因测序技术检测里岔黑猪肠道菌群辅助育种的方法，属于生物技术分子育种技术领域。包括：提取里岔黑猪粪便的总DNA并扩增，建库测序后分析得到与饲料利用率相关的普氏菌属、密螺旋体属、瘤胃球菌...; 赵卿尧刘年丰

一种基于多重PCR技术和高通量测序技术的微生物核酸检测技术和试剂盒: 本发明提出了一种基于多重PCR技术和高通量测序技术的微生物核酸检测技术和试剂盒。该技术流程主要包括：引物设计、多重PCR扩增、片段化建库、上机测序以及生信分析，可快速、准确地检测微生物病原体。该检测试剂盒主要包含多对细菌...; 刘莉莉高晓庆王计超姚瑶朱莉莉周逸文丁文超韩序王珺

加载更多 ∨

相关作者

用户反馈

相关作者

用户登录

用户反馈