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鸡TLR1A基因正选择nsSNP与沙门氏菌易感性的关联性研究被引量：2: 2023年; 为探究鸡TLR1A基因正选择nsSNP位点与沙门氏菌易感性的关联,挖掘其潜在的功能性位点,本研究利用多种生物信息学方法对ChTLR1A的21个nsSNP位点及基因的选择压力进行综合分析,筛选ChTLR1A正选择nsSNP功能性位点,深入分析其与鸡沙门氏菌易感性之间的相关性。结果显示,rs739087452(I388L)和rs313678806(C815R)在种上及种内均受到正选择作用,且rs739087452(I388L)位点的变异使其蛋白稳定性降低。rs313678806(C815R)与鸡沙门氏菌的易感性显著相关(P<0.001),C/C基因型为沙门氏菌抵抗型,表明rs313678806(C815R)可能是影响鸡沙门氏菌易感性的重要功能性SNP。本实验结果可为TLR1A基因标记在鸡抗病育种中的利用提供参考依据。; 孟婕张传生张夕霏周泽宇张贝李可李祥龙耿立英; 关键词：沙门氏菌正选择

一种基于snakemake流程的正选择基因的检测方法和系统: 本发明公开了一种基于snakemake流程的正选择基因的检测方法，能够高效快速鉴定目标物种受正选择基因，为解析物种环境适应性的分子机制、物种演化提供分子依据。本发明还公开了一种实现上述方法的检测系统，所述检测系统具体包括...; 安冬肖云平史贤俊林博刘钰钏顾胤聪鲍志贵范旭蕾

登革病毒在人与蚊虫细胞正选择压力下的致病性与基因序列变化分析: 2022年; 自然界中登革病毒在蚊虫与哺乳动物宿主内交替循环复制,研究病毒与不同类型宿主细胞间的相互作用有助于理解病毒基因突变与毒力变化的关系。本研究将登革2型病毒在人肝癌细胞(Huh-7)和蚊虫细胞(C6/36)之间交替传代模拟登革病毒在自然界中的人类与蚊虫间的交替感染,通过检测第10、18代病毒对小鼠的毒力以及在蚊虫中的感染率、传播率来评价病毒的适应性,同时对病毒基因组进行了测序。结果显示,登革2型病毒经交替传代后适应性降低,单种细胞中连续传代后适应性增高。序列分析显示病毒在C6/36细胞中连续传代后积累的突变数少于在Huh-7细胞中连续传代或两种细胞中交替传代积累的突变。另外,连续传代过程中出现的E蛋白155和186位点的氨基酸突变可能与毒力增强有关,交替传代过程中出现的E蛋白307位点氨基酸突变可能与毒力减弱有关。结果揭示了登革病毒毒力变化与基因突变的关系,有助于监测病毒毒力变化,预测疾病的流行。; 朱小娟姜玉庭张恒端高剑吴治明李春晓董言德邢丹郭晓霞赵彤言; 关键词：登革2型病毒毒力

基于修正选择模型的沿海湿地生态系统服务价值评估研究 ——以广西北部湾地区红树林为例: 沿海湿地生态系统服务价值的评估对于实现沿海湿地资源的科学开发和有效利用具有重要意义。已有研究证明,在选择实验(CE)评估框架中加入属性截断值(Cut-off)能够提高评估结果的效度,但我们还不能区分这一改进提升到底是由于...; 金夕航; 关键词：沿海湿地生态系统服务生态补偿标准

一种基于snakemake流程的正选择基因的检测方法和系统: 本发明公开了一种基于snakemake流程的正选择基因的检测方法，能够高效快速鉴定目标物种受正选择基因，为解析物种环境适应性的分子机制、物种演化提供分子依据。本发明还公开了一种实现上述方法的检测系统，所述检测系统具体包括...; 安冬肖云平史贤俊林博刘钰钏顾胤聪鲍志贵范旭蕾; 文献传递

驯化酵母mRNA二级结构在同义位点受到广泛的正选择: mRNA是一类将遗传信息从DNA传递至蛋白质的核糖核苷酸分子链。作为分子生物学中心法则的关键节点,mRNA在整个信息传递过程中起到承上启下的作用。新近研究发现,mRNA与其他单链RNA分子相似,可以通过分子内碱基互补配对...; 于明皓; 关键词：MRNA二级结构正选择驯化

正选择基因无启动子的供体质粒pN(CDS)(N2)-R的构建及应用: 2019年; 为提高对发生基因编辑细胞的筛选效率,本研究构建了具备正负筛选功能的供体质粒pN(CDS)(N2)-R,其正选择基因是无启动子NeoR,负选择基因是能自主表达的RED。利用该质粒和CRISPR-Cas9系统对小鼠B16细胞FasL进行编辑。G418筛选2周,获得混合克隆。镜下观察显示,混合克隆质量较高。junction PCR结果表明,有基因编辑发生。DNA测序结果表明,NeoR准确插入靶位点。细胞杀伤实验表明,FasL功能被有效敲除。该供体质粒的多克隆位点,充分利用同尾酶酶切位点,因而具有广泛的适用性。综上所述,在对各种位点进行编辑时,使用该供体质粒有助于混和克隆的筛选。; 王英泽曹晴晴马文惠王凤利薛巍王晨晨杜朝; 关键词：同源重组 FASL

选择性清除与正选择在粳籼稻分化过程当中的作用研究: 亚洲栽培稻（OryzasativaL.）包括粳稻(japonica)和籼稻（indica）两个亚种，是亚洲乃至世界上最重要的作物之一，目前已成为全世界半数以上人口的主粮。然而长期以来，粳籼稻亚种的起源与分化过程仍存在争议...; 薛世杰; 关键词：基因组测序; 文献传递

正选择驱动小反刍家畜重复基因的多样性变化: 脊椎动物共经历了两次全基因复制。现有研究认为，基因复制是生物表型多样化的基础。基因复制提供了新的拷贝，这些拷贝在正选择的作用下形成新的基因。在复制后基因的命运有两种:其中一些失去功能变成伪基因，另一些则被保留下来形成新基...; HAFIZ ISHFAQ AHMAD; 关键词：基因复制种群分化适应性进化; 文献传递

绞股蓝转录组测序挖掘三萜合成基因与鲨烯合酶正选择位点突变表达载体构建: 文章主要从以下几部分进行论述：　　第一部分绞股蓝转录组测序挖掘三萜合成通路及相关酶基因　　目的:通过对绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum(Thunb.)Makino，G.pentaphyllum)的...; 陈奇聪; 关键词：绞股蓝鲨烯合酶转录组测序

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