搜索到436篇“ 查尔酮合酶基因“的相关文章
- 一种何首乌查尔酮合酶基因FmCHS2及其编码产物和应用
- 本发明涉及一种何首乌查尔酮合酶基因FmCHS2及其编码产物和应用,所述基因FmCHS2的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述编码产物氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。何首乌查尔酮合酶基因FmCHS2是何首乌...
- 彭华胜杨正阳赵玉姣尹旻臻储姗姗童珍珍覃月健
- 斑地锦查尔酮合酶基因及启动子的克隆与分析被引量:2
- 2023年
- 黄酮类化合物槲皮素是斑地锦主要药效成分之一,而查尔酮合酶(CHS)是槲皮素生物合成过程中的关键酶。为阐明斑地锦中槲皮素生物合成机制,本研究以斑地锦为材料,根据转录组测序数据结合3'RACE、Tail-PCR技术,克隆了CHS基因及其启动子,将该基因命名为EmCHS(GenBank登录号为ON652865)。对EmCHS蛋白进行氨基酸序列比对、理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位和系统进化树等分析,并采用实时荧光定量PCR技术检测EmCHS在不同生长期不同组织中的表达情况。结果显示,EmCHS开放阅读框(ORF)全长为1194 bp,编码397个氨基酸,EmCHS蛋白定位于细胞质,理论等电点为5.96,相对分子质量为43.48 kD,不含跨膜区域,为结构稳定的亲水性蛋白。氨基酸序列比对和系统进化树分析结果显示,EmCHS与同为大戟科的木薯氨基酸序列相似性最高(91.92%),符合植物分类学的特点。RT-qPCR实验表明,EmCHS基因在斑地锦不同生长期不同组织中均有表达,且存在明显差异,在生殖生长期叶内表达水平最低,生殖生长期根内表达水平最高。克隆到的EmCHS启动子(GenBank登录号为OP626754),长度为971 bp,生物信息学分析结果显示,其既含TATA-box、CAAT-box等基本序列,也含有MYB、MYC等转录因子结合位点、多个光反应元件(G-box等)和激素反应元件(ABRE等)等顺式作用元件。实验结果为进一步研究斑地锦CHS基因功能及表达调控奠定基础。
- 郭三保宋美玲李灵心尧子钊桂明明黄胜和
- 关键词:CHS启动子克隆生物信息学基因表达
- 茄子查尔酮合酶基因的克隆与生物信息学分析被引量:1
- 2023年
- 以“杭茄1号”紫茄子苗为试材,采用RT-PCR方法克隆CHS基因,利用DNAMAN、MEGA 7.0.26及一些在线网站研究了CHS基因所编码蛋白的结构与功能,以期为研究查尔酮合酶CHS基因在茄子的生长发育中的意义及植物类黄酮的生物合成及其分子机制提供参考依据,同时丰富了双子叶植物CHS超家族的相关研究。结果表明:获得CHS基因全长为1170 bp,预测该基因编码的蛋白很有可能定位于细胞质中。系统进化分析表明,紫茄子与番茄、芒果、咖啡、短茄在同一个分支,亲缘关系最近,均属于茄科植物。
- 何金娇张万方侯玥如徐鑫毛雪飞吴云舟
- 关键词:查尔酮合酶基因克隆生物信息学分析
- 漆树查尔酮合酶基因家族生物信息学分析被引量:1
- 2023年
- 查尔酮合酶(CHS)是黄酮类化合物合成过程中的关键酶。为了进一步探索CHS基因家族在调控黄酮类物质合成中的功能,本研究对12个漆树CHS基因编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、蛋白二级结构以及系统进化等方面进行初步生物信息学分析。保守结构域分析发现12个TvCHS基因均含有CHS-Like保守序列;12个TvCHS基因除了TvCHS10在叶中不表达和TvCHS11在根中不表达,其余10个基因在漆树根茎叶都有表达;12个CHS蛋白中有4个疏水蛋白、8个亲水蛋白。在系统进化分析中,漆树CHS基因家族12个基因被划分为两个组。信号肽预测分析发现12个TvCHS基因均为非分泌蛋白;磷酸化位点预测分析发现丝氨酸和苏氨酸磷酸化位点数量最多,络氨酸最少。本研究对漆树CHS基因家族进行鉴定和分析,为进一步研究漆树CHS基因家族的功能提供了一定的参考和依据。
- 孔娇黄晓华赵爱国
- 关键词:漆树生物信息学分析
- 一种何首乌查尔酮合酶基因FmCHS1及其编码产物和应用
- 本发明涉及一种何首乌查尔酮合酶基因FmCHS1及其编码产物和应用,该基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;该基因的编码产物氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明所提供的何首乌查尔酮合酶基因FmCHS1是首...
- 彭华胜杨正阳赵玉姣程铭恩尹旻臻童珍珍方清影
- 文献传递
- 一种何首乌查尔酮合酶基因FmCHS2及其编码产物和应用
- 本发明涉及一种何首乌查尔酮合酶基因FmCHS2及其编码产物和应用,所述基因FmCHS2的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述编码产物氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。何首乌查尔酮合酶基因FmCHS2是何首乌...
- 彭华胜杨正阳赵玉姣尹旻臻储姗姗童珍珍覃月健
- 文献传递
- 彩色马铃薯查尔酮合酶基因的克隆及生物信息学分析被引量:3
- 2022年
- 为了研究彩色马铃薯块茎中花色苷积累的分子机制,明确查尔酮合成酶(CHS)在花色苷合成途径中作用,本研究以彩色马铃薯品种‘红美’块茎作为实验材料,根据GenBank数据库中已注册马铃薯CHS基因的cDNA序列设计引物,通过RT-PCR方法克隆了一个CHS基因,命名为StCHS1b。StCHS1b基因cDNA序列共1 223 bp,开放阅读框为1 170 bp,编码389个氨基酸。分子质量约为42.48 kD,理论等电点为6.3。生物信息学分析表明,该蛋白为亲水性的稳定蛋白质,而且含有CHS家族序列标签的保守区域GVLFGFGPGLT,无信号肽,不含有跨膜区。Blastn分析表明,StCHS1b基因序列与其他物种的CHS基因序列均具有较高同源性,编码区氨基酸相似性高达99%。进化分析表明,彩色马铃薯StCHS1b与番茄SlCHS、茄子Sm CHS、辣椒CaCHS、烟草NtCHS和黑果枸杞LrCHS聚在同一个分支,都属于茄科,它们的亲缘关系最近,与苹果MdCHS和覆盆子RiCHS亲缘关系较远。
- 聂利珍李晓东谢锐房永雨
- 关键词:彩色马铃薯查尔酮合成酶基因基因克隆生物信息学分析
- 大花君子兰查尔酮合酶基因CmCHS的克隆及其功能验证被引量:6
- 2021年
- 为研究大花君子兰(Clivia miniata)查尔酮合酶的结构及功能,基于前期构建的大花君子兰转录组数据库,对参与花青素合成的CHS基因家族进行鉴定和筛选。在大花君子兰中克隆得到4个CmCHS(CmCHS1~CmCHS4),其开放阅读框全长分别为1173、1170、1173和1173 bp,编码390、389、390、390个氨基酸。氨基酸序列比对分析证实,CmCHS具备该基因家族典型的保守结构域。进化树分析结果显示,4条CmCHS属于真实的CHS,编码蛋白属于Ⅲ型聚酮合成酶(PKS),亚细胞定位于细胞质和细胞核中。基因表达特异性分析结果表明,CmCHS1和CmCHS2在花朵初开和盛开期表达量较高;CmCHS1、CmCHS2、CmCHS3在红色叶片和果皮中的表达量大大高于绿色叶片和果皮,CmCHS4则相对较低。构建原核表达载体pET-32-CmCHS,体外酶活检测表明,4个CmCHS重组蛋白皆可催化香豆酰辅酶A和丙二酰辅酶A生成柚皮素查尔酮。
- 刘玥李月庆孟祥宇黄靖汤昊李源恒高翔赵春莉
- 关键词:君子兰类黄酮查尔酮合酶酶活
- 怀玉山三叶青查尔酮合酶基因克隆和表达分析
- 2021年
- 本研究通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到其查尔酮合酶基因的核心片段,利用qRT-PCR技术克隆到其查尔酮合酶基因,并采用生物信息学方法和实时定量PCR进行序列分析和器官表达分析,以期为揭示怀玉山三叶青查尔酮合酶的生物学功能提供理论依据。结果表明,怀玉山三叶青查尔酮合酶基因cDNA总长度为1143 bp,G+C含量为65.27%;由380个氨基酸组成,分子量41809.23 Da,等电点6.19,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(37.37%)、β-片层(19.47%)、无规则卷曲(43.16%)构成,三级结构为二聚体;该酶主要存在于细胞核和线粒体中,在进化上与硬粒小麦(Triticum turgidum subsp.durum)、节节麦(Aegilops tauschii subsp.tauschill)、小麦(Triticum aestivum)的亲缘关系较近,尤其与硬粒小麦的未命名蛋白产物(VAH38240.1)亲缘关系最近。实时定量PCR结果显示,查尔酮合酶基因在怀玉山三叶青2个栽培种‘怀玉2号’和‘怀玉1号’中的表达存在器官特异性,均在根中表达量最高。综上,怀玉山三叶青查尔酮合酶具有查尔酮合酶的典型结构特征,氨基酸序列及核苷酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,这对进一步揭示该酶的生物学功能具有重要意义。
- 洪森荣刘佳刘军刘依婷陈荣华蔡红
- 关键词:查尔酮合酶基因克隆
- 栾树查尔酮合酶基因克隆与表达分析
- 2021年
- 【目的】查尔酮合酶(CHS)是苯丙烷途径的限速酶之一,在植物次生代谢物的合成中起着重要的作用。本研究通过对栾树CHS基因进行克隆与生物信息学分析,以及分析栾树CHS基因表达与类黄酮合成的关系,期望为后续深入研究栾树类黄酮代谢途径其他相关基因、CHS基因家族以及锦叶栾呈色机制提供参考。【方法】以栾树叶片为材料,采用RTPCR技术进行查尔酮合酶基因的克隆并进行生物信息学分析;通过实时定量PCR(qRT-PCR)技术分析CHS基因在栾树不同组织以及在5月、7月、9月的栾树和锦叶栾叶片中的表达模式;通过代谢组测定筛选出栾树与锦叶栾的类黄酮差异代谢物。【结果】克隆获得两个CHS基因的全长DNA,命名为KpCHS1和KpCHS2。其中KpCHS1序列全长为2492 bp,ORF为1173 bp,编码含有390个氨基酸的蛋白质;KpCHS2序列全长为1321 bp,ORF为1182 bp,编码含有393个氨基酸的蛋白质;进一步的序列比对和系统发育分析表明,KpCHS1和KpCHS2蛋白高度同源,具有四个CHS特异性保守基序和一个查尔酮合成酶活性位点;KpCHS1和KpCHS2在栾树根、茎、叶、种子中都普遍表达,其中,KpCHS2在种子中的表达量最高,KpCHS1在叶片中表达量高,而在根和茎中,两个基因的表达量相似且较低;表达模式分析显示,在栾树和锦叶栾叶片中,随着月份增加,KpCHS1的表达量呈现出下降的趋势,而KpCHS2表达量未表现出明显的规律。在7月份的叶片样本中,KpCHS1基因在锦叶栾中表达量显著高于栾树;代谢组结果显示,山奈酚-7-O-葡萄糖苷、7-羟基香豆素、槲皮素-3β-D-葡萄糖苷、以及类黄酮生物合成途径重要的中间产物山萘酚、柚皮苷等黄酮类物质在锦叶栾叶中含量显著升高。【结论】KpCHS1和KpCHS2属于栾树查尔酮合酶家族并且高度同源,但在系统进化树上分布在很远分支上,推测这两个蛋白在氨基酸活性催化功能上可能存在较大差异;KpCHS1�
- 郭婷黄赛吴茹茜安新民
- 关键词:栾树查尔酮合酶克隆
相关作者
- 李成磊
- 作品数:58被引量:317H指数:11
- 供职机构:四川农业大学生命科学与理学院
- 研究主题:苦荞 基因克隆 克隆 克隆及序列分析 金龙胆草
- 张君诚
- 作品数:134被引量:631H指数:13
- 供职机构:三明学院
- 研究主题:金线莲 花生 石杉 五指毛桃 石杉碱甲
- 宋育红
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- 供职机构:三明学院
- 研究主题:金线莲 石杉 次生代谢产物 物种多样性 合酶基因
- 付新生
- 作品数:10被引量:26H指数:2
- 供职机构:天津市园林绿化研究所
- 研究主题:查尔酮合酶基因 花卉 仙客来 查尔酮合酶 基因导入
- 邢建宏
- 作品数:83被引量:275H指数:10
- 供职机构:三明学院
- 研究主题:马尾松 雷公藤 金线莲 秋茄 草珊瑚