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eDNA监测测序数据分析注释中参考数据库选择、指标阈值选择、目标数据准备的影响——以长江中游鱼类为监测目标: 2024年; 在基于宏条形码(meta-barcoding)的eDNA监测技术中,eDNA测序数据的分析和注释是决定监测结果判断和评估精准与否的基础,而参考数据库选择、指标阈值选择、目标数据准备是eDNA测序数据分析和注释中最为关键的3个技术环节。为厘清上述3个技术环节处理方案的影响,本研究以长江中游2组eDNA监测COI基因测序数据为分析对象,针对鱼类的检出进行3组实验来分别检验:1)不同参考数据库及物种注释算法对注释结果的影响;2)不同OTU聚类序列相似度和物种注释分类置信度(序列一致性和序列覆盖度)对注释结果的影响;3)目标数据中各物种不同序列丰富度对注释结果的影响。结果显示:1)Blast算法下,3个版本nt库注释出的物种基本一致(72%~78%),2个本地序列参考库注释出的物种也基本一致(91%~96%),这5个序列参考库注释出的物种52%~68%一致;nt库RDP Classifier算法注释出的物种覆盖95%以上Blast算法注释出的物种,并比Blast算法注释出的物种多151%~443%,多出的物种大都是错误注释,本地参考数据库RDP Classifier算法注释出的物种覆盖66%~85%的Blast算法注释出的物种,并存在数条只注释到科属的结果。2)OTU聚类序列相似度阈值,取值0.999比取值0.99获得的OTU多154%~209%,注释到鱼类的OTU多240%~490%;注释分类置信度阈值(Blast算法,序列一致性和序列覆盖度)从0.8到0.99注释获得的物种组成(94%以上)基本一致,OTU组成(83%以上)也基本一致,注释分类置信度阈值取0.7时注释获得的物种组成、OTU组成与取0.8及以上时注释获得的有较大差异。3)在OTU聚类序列相似度阈值为0.999、注释分类置信度阈值为0.9时,多序列数据注释所得鱼类物种数、OTU数最多,物种注释正确率最高(达81.49%),分别比单序列数据的多7%、215%和高5%。在具体eDNA测序数据的分析和注释中,可通过建立完善本地参考数据库、优化OTU聚类序列相似度和物种注; 许兰馨杨海乐刘志刚杜浩; 关键词：鱼类长江中游

数据库选择率计算的优化方法、存储介质与设备: 本发明提供了一种数据库选择率计算的优化方法、存储介质与设备。其中上述方法包括：提取谓词AND连接的第一约束子句；将第一约束子句中存在函数依赖关系的列根据函数依赖关系合并作为第一目标列集合，并逐一计算第一目标列集合中每个合...; 王源春尹强徐登峰冷建全

一种数据库选择率估算装置及方法: 本发明涉及一种数据库选择率估算装置及方法，该装置包括数据生成器、样本数据池、累积分布函数拟合器和查询选择率计算器；数据生成器，被配置为生成负载样本；样本数据池，被配置为接收和存储来自所述数据生成器的负载样本；累积分布函数...; 李翠平陈红孙路明姬涛

区间正态信息集成算法的数据库选择模型被引量：3: 2020年; 在区间正态模糊信息环境下,对于指标权重信息完全未知的多属性群决策问题,设计了两种信息集成算法,建立一种区间正态模糊多属性群决策模型。首先给出区间正态模糊数的基本运算规则;然后,分别从算术和几何角度设计了区间正态模糊加权平均(IVNFWA)算子和区间正态模糊加权几何(IVNFWG)算子,同时对新建立的2个算子进行大小比较分析;最后在区间正态模糊信息环境下将提出的信息集成算法与距离公式相结合,构建一种属性权重完全不可知的多属性决策模型;结合数据库系统选择实例,对提出的决策方法进行验证。测试结果表明,提出的多属性决策方法是正确的、可行的与高效的。; 周天绮刘梦; 关键词：多属性决策数据库系统

用于提纲检测的自适应数据库选择系统: 本发明涉及一种用于提纲检测的自适应数据库选择系统，包括：面部识别设备，用于对当前用户的面部特征进行识别以确定当前用户是否为合法用户，并在确定为合法用户时，发出第一识别命令，否则，发出第二识别命令；数据库重置设备，与所述面...; 欧峥; 文献传递

基于从数据库选择的策略进行加工: 本发明涉及基于从数据库选择的策略进行加工。本发明提供方法及相应的系统和计算机程序产品。获得(210)待制造的物体的模型。获得(220)关于可利用的一个或多个机床(110)和可利用的一个或多个切削刀具(120)的信息。识别...; 胡戈·诺德尔瓦希德·卡尔霍里; 文献传递

基于犹豫语言信息集结算法的数据库选择被引量：1: 2019年; 为了提高数据库选择效率,针对多属性群决策问题提出了一种基于犹豫语言多属性群决策算法的数据库选择方法。首先,构建一种基于广义犹豫语言Heronian平均(GHLHM)算子的数据库选择模型。其次,将Archimedean范数引入到犹豫语言环境下,定义了新的犹豫语言运算法则;其次,基于新的运算法则和Heronian平均,提出了GHLHM算子,并探讨了GHLHM算子的一些基本性质,研究了GHLHM算子的几类常用算子形式,提出了广义犹豫语言加权Heronian平均(GHLWHM)算子;最后,基于GHLWHM算子构建了一种新的犹豫语言多属性群决策方法并将其应用于数据库选择中,实验证明,该方法可以实现对数据库性能的综合优选排序,在其他领域也有着广泛的应用前景。; 高婷王晓楠; 关键词：多属性群决策数据库

数据库选择方法及系统: 本发明提供一种数据库选择方法及系统。该数据库选择方法包括：解析用户交易请求，得到第一交易号码和第二交易号码；根据第一交易号码和第二交易号码创建map集合，并将map集合设置为本地线程变量；根据本地线程变量和预设的路由规则...; 苗海柱; 文献传递

基于模糊交叉效率的数据库选择研究: 2018年; 交叉效率模型下决策单元自评值最优时的权重组合存在非唯一性，造成他评值不同，影响到综合效率值和排序结果。区间值构成交叉效率值，又过于模糊，增加了决策的不确定性。因此，针对权重组合的多重最优解，提出基于犹豫模糊集的交叉效率群决策方法。在原有决策单元下构建正负理想决策单元，选取从“仁慈“到“进取”的5个模型代表由悲观到乐观过渡的决策者，用犹豫模糊元表示群决策下的交叉效率值，进而构建犹豫模糊交叉效率矩阵；引入多目标优化方法确定属性的权重：改进贴近度公式，计算决策单元与正负理想决策单元的相对贴近度并进行排序。最后通过数据库系统的选择实例说明提出的决策方法是合理和有效的。; 谭丹丹谭晶晶; 关键词：群决策数据库系统

基于改进粗糙集-AHP的数据库选择研究被引量：5: 2018年; 为了充分发挥主观赋权法与客观赋权法这两类评价方法的优势,同时避免这两类评价方法存在缺陷,达到两者优势互补、扬长避短的目的,首先运用层次分析法计算决策者的主观权重,利用改进的粗糙集法计算客观权重;然后构建新的最优化模型将专家经验与客观数据进行融合,用以确定组合权重,进而获取主观权重与客观权重相结合的最优组合权重。最后通过数据库的选择实例进行验证,实验表明提出的方法是合理有效的,可以使决策的准确性得到提高,具备实用性与推广价值。; 杨永强李淑红; 关键词：层次分析法数据库

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