搜索到4327篇“ 家族基因“的相关文章
番茄HD-Zip家族基因鉴定及非生物胁迫下HD-ZipⅢ亚家族基因的表达分析
2025年
为探究番茄HD-Zip家族成员的特征及HD-ZipⅢ亚家族成员在非生物胁迫响应中的作用,我们对番茄HD-Zip家族进行了全基因组鉴定与非生物胁迫下的表达分析。结果显示,从番茄中共筛选出56个HD-Zip家族基因,不均匀地分布在12条染色体上;这些基因被分成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四个亚家族,同一亚家族基因具有相似的理化性质、基因结构、保守基序和保守结构域。对番茄HD-Zip家族基因主要顺式作用元件的预测结果显示,MeJA响应元件出现的频率最高,MeJA能诱导防御性化合物的合成并启动与全身获得性抗性和局部抗性有关的发病机制相关基因的表达,推测这些基因可能在番茄抗逆性中发挥重要作用。共线性分析发现,番茄HD-Zip家族基因中有30个基因存在共线性,而番茄与拟南芥HD-Zip家族基因间有34对基因存在共线性。基因表达分析结果显示,HD-ZipⅢ亚家族基因均在番茄植株根中表达,而且对冷、盐、干旱、ABA等非生物胁迫均有响应,但不同基因受各胁迫诱导的表现不同,其中,Soly03g120910在冷胁迫下表达量显著提高,处理6 h时达到最高,与0 h相比上调了10.3倍,同时该基因也受干旱胁迫诱导上调表达,处理6 h时的表达量与0 h相比提高了1.6倍;Solyc11g069470对盐胁迫响应最强,处理3 h时表达量最高,与0 h相比上调1.0倍;Soly08g066500对ABA处理响应最强,处理6 h时的表达量与0 h相比上调了5.4倍。本研究结果可为深入研究HD-Zip家族基因在植物逆境响应中的作用机制奠定基础。
张鑫郭旭东藏日娜张顺智朱文莹王富王辉
关键词:番茄非生物胁迫
ABC转运蛋白家族基因OsABCA3在植物育种调控中的应用
本发明公开了ABC转运蛋白家族基因<I>OsABCA3</I>在植物育种调控中的应用。属于植物基因工程领域。ABC转运蛋白家族基因<I>OsABCA3</I>在植物育种调控中的应用,所述的ABC转运蛋白家族基因<I>Os...
易继财许鑫鑫莫清藓蔡泽斌叶荣
易洛魁同源盒家族基因IRX3在肝癌诊断、预后和治疗中的应用
本发明公开了易洛魁同源盒家族基因IRX3在肝癌诊断、预后和治疗中的应用:检测生物标志物易洛魁同源盒家族基因IRX3表达的试剂在制备用于对肝癌对象进行辅助诊断或者诊断或者预后的产品中的应用;IRX3作为靶标在筛选治疗肝癌的...
范辉杨丽娟
易捕鲤生肌调节因子家族基因鉴定及养殖模式对其表达、生长和肌肉质构的影响
2025年
试验旨在探究易捕鲤生肌调节因子家族基因及养殖模式对易捕鲤生肌调节因子家族基因表达、生长和肌肉质构的影响。选取规格均一的易捕鲤90尾,随机分为2组,每组3个重复,每个重复15尾易捕鲤。静水组(CK组)和流水组(EG组)均投喂鲤鱼鱼种配合饲料。预试期1 w,正式试验期73 d。结果显示,通过NCBI BLAST比对发现易捕鲤肌肉生肌因子6 (myf6)、成肌分化因子(myoD)与鲤鱼高度同源,肌细胞生成素(myoG)在进化上明显处于一个单独的分支,使用β-actin作为内参基因,通过荧光实时定量PCR发现,在静水养殖模式下,易捕鲤myf6、myoD表达量显著高于流水组(P<0.05);在2种养殖模式下,myoG的表达无显著差异(P>0.05)。在2种养殖模式下,易捕鲤期的生长性能、肌肉质构和营养特性均无显著差异(P>0.05)。研究表明,受集约化养殖成本较高的影响,应慎重选择易捕鲤作为集约化循环水养殖对象。
李晓东焦飞李林胡建勇高攀王雪刘晶时春明
关键词:肌肉品质基因表达
野生二粒小麦AP2家族基因鉴定与表达模式分析
2025年
AP2转录因子在植物信号转导、生长发育和胁迫响应方面发挥着重要作用。为探索AP2转录因子在野生二粒小麦中的分子特征,基于野生二粒小麦基因组信息,采用Blast和Hmmer进行AP2家族成员鉴定,对鉴定到的成员进行蛋白质理化性质、亚细胞定位、系统进化树、保守结构域、基因扩增、顺式作用元件、密码子偏好性、表达模式和遗传多样性分析。结果表明,在野生二粒小麦中共鉴定到265个AP2基因,主要定位在细胞核和叶绿体中。根据系统进化树将其分为3个亚族,各亚族之间的保守结构域和基因结构存在保守性与多样性。AP2含有多个与生长发育和非生物胁迫相关的顺式作用元件。AP2基因的密码子偏好性可能受到压力选择作用。从AP2基因的表达模式看,该家族成员可能发生了亚功能化,且对盐胁迫响应有重要作用。通过对不同小麦群体中核酸多样性和分化指数分析,AP2基因部分成员在野生二粒小麦中具有较高的遗传多样性。
刘涛曹启彬卫科旭张艳聂小军童维
关键词:野生二粒小麦进化分析
茶树钙调蛋白结合转录激活因子(CAMTA)家族基因鉴定与表达分析
2025年
为了解茶树钙调蛋白结合转录激活因子(calmodulin-binding transcription activator,CAMTA)家族成员的功能,探究其表达特性,利用生物信息学方法在茶树全基因组中鉴定CsCAMTAs基因,并对其理化性质、基因结构、结构域、保守基序、系统进化、顺式作用元件进行分析,利用qRT-PCR技术分析CsCAMTAs在不同组织、不同激素处理和病菌胁迫下的表达情况。结果表明,在茶树全基因组中共鉴定出10个CsCAMTAs成员,共包含10个motifs,分布在6条染色体,均定位于细胞核。不同CsCAMTAs基因差异较大,氨基酸数目为124~1 419个,编码蛋白等电点为4.976~9.820,除1个为弱疏水蛋白外,其他均为亲水蛋白。系统进化分析将茶树10个CsCAMTAs基因划分为4个类群,有4个同源基因对,同源基因对在基因结构、保守结构域、保守基序数量和相对位置等方面具有较高相似性。CsCAMTAs启动子区含有34个与光响应、激素诱导以及生物胁迫相关的顺式作用元件。表达分析结果显示,CsCAMTAs在不同组织的表达有明显差异,其中CsCAMTA1、3、4、7、8、10在老叶中的表达水平较高;除CsCAMTA5不受茉莉酸甲酯诱导外,其他CsCAMTAs基因均受茉莉酸甲酯、脱落酸、水杨酸及茶轮斑病菌诱导表达,由此说明CsCAMTAs不仅调控茶树生长发育,还参与茶树对病菌和激素的应答。
刘金仙王丽娟刘杰傅仙玉武广珩
关键词:茶树生物信息学分析
辣椒C_(2)H_(2)型锌指蛋白家族基因鉴定及其在涝胁迫下的表达分析
2025年
为了探究辣椒C_(2)H_(2)型锌指蛋白家族在响应涝胁迫中的作用,本研究通过生物信息学方法对辣椒C_(2)H_(2)型锌指蛋白家族蛋白理化性质、基因结构、染色体定位、顺式作用元件进行了全面分析。结果表明,辣椒C_(2)H_(2)型锌指蛋白家族包含91个成员,多数成员定位于细胞核。91个成员可被分为6个亚族,不同亚族的成员基因结构存在差异。C_(2)H_(2)型锌指蛋白家族基因启动子区域主要包含植物生长发育元件、植物激素响应元件及逆境胁迫响应元件。对耐涝辣椒资源GC41和涝胁迫敏感型辣椒资源GC39在涝胁迫下的转录组数据进行分析,结果表明,在GC41中,CaC_(2)H_(2)-17、CaC_(2)H_(2)-87在涝胁迫处理3 d时相对表达量高,CaC_(2)H_(2)-17、CaC_(2)H_(2)-87在GC39中未表达。筛选出CaC_(2)H_(2)-16(Capana01g003556)、CaC_(2)H_(2)-32(Capana04g001616)、CaC_(2)H_(2)-72(Capana11g000176)、 CaC_(2)H_(2)-73(Capana11g000178)、CaC_(2)H_(2)-87(Capana12g000773)5个转录因子,这5个转录因子分别调控了419个、526个、566个、305个、480个差异表达基因。本研究结果为辣椒C_(2)H_(2)家族成员的功能解析及耐涝辣椒资源的分子育种提供了重要的理论依据和数据支持。
王楠艺范高领付文婷吴迪杨娅黄冬福王立浩吴康云何建文
关键词:辣椒生物信息学
一个栽培大豆SDR家族基因GmGAE47的应用
本发明公开了一个栽培大豆SDR家族基因GmGAE47的应用。栽培大豆GmGAE47蛋白编码基因GmGAE47,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.1。将构建的植物过量表达载体Pba002‑GmGAE47在拟南芥的野生型中...
黄方喻德跃吴菲王乙臣杨中义徐小倩
大豆COX VIB家族基因GmCOX6b的应用
本发明公开了大豆COX VIB家族基因GmCOX6b的应用。大豆GmCOX6b蛋白编码基因GmCOX6b,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.1。将构建的植物过量表达载体pBA002‑GmCOX6b在大豆受体Jack中表...
黄方喻德跃吴菲杨中义王慧阚贵珍
豆科植物单锌指家族基因的应用
本发明公开了豆科植物单锌指家族基因的应用。豆科植物单锌指蛋白编码基因在通过基因工程手段调控蒺藜苜蓿分枝数、开花时间和/或生物量中的应用;所述的豆科植物单锌指蛋白编码基因选自SEQ ID NO.1所示的蒺藜苜蓿MtSBM1...
黄方苏晓月喻德跃王娇王慧

相关作者

黄方
作品数:65被引量:83H指数:5
供职机构:南京农业大学
研究主题:大豆 蛋白编码基因 家族基因 编码基因 转录因子
喻德跃
作品数:267被引量:1,195H指数:20
供职机构:南京农业大学
研究主题:大豆 编码基因 蛋白编码基因 转录因子 野生大豆
阚贵珍
作品数:56被引量:54H指数:4
供职机构:南京农业大学
研究主题:大豆 蛋白编码基因 家族基因 野生大豆 编码基因
王慧
作品数:95被引量:101H指数:6
供职机构:南京农业大学
研究主题:大豆 蛋白编码基因 编码基因 家族基因 抗虫性
邢继红
作品数:143被引量:216H指数:8
供职机构:河北农业大学
研究主题:拟南芥 灰葡萄孢 致病力 玉米 转录因子