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黄瓜绿斑驳花叶病毒基因介导基因烟草方法
本发明公开CGMMV基因介导基因烟草方法。针对现有技术不能利用重组质粒构建含CGMMV来源基因片段的具有发卡结构的ihpRNAi植物表达载体并能成功获得抗性烟草的方法的缺陷,本发明首先提供重组质粒pHellsgate2...
刘丽锋周建华周厚成古勤生刘莉铭
由番茄红素基因介导的改造的克隆载体及其应用
本发明属于基因工程领域,涉及一系列由番茄红素基因介导的改造的克隆载体及其应用,所述改造的克隆载体是将番茄红素基因克隆至穿梭质粒pCCI‑Brick和pUC57‑Brick中,并在番茄红素基因序列的两端分别添加只出现一次且...
马小舒李一凡王嫚吴政宪
肺缺血-再灌注核心基因介导的竞争性内源性RNA网络的构建
2024年
目的分析肺缺血-再灌注损伤发生的核心基因并构建竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE145989的原始数据当作训练集,GSE172222和GSE9634数据集作为验证集,并鉴定差异表达基因(DEG)。进行基因本体(GO)、京都基因基因组百科全书(KEGG)富集分析。构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心基因并分析核心基因的诊断价值、免疫细胞的免疫浸润水平。构建并验证ceRNA网络。分析基于ceRNA网络的靶向药物。结果共检测到179个DEG,其中61个下调基因,118个上调基因。GO分析结果显示,DEG与细胞迁移、分化和调节等生物学过程有关;与内吞囊泡膜、浆膜和膜筏等细胞成分有关;与趋化因子受体、G蛋白偶联受体、免疫受体活性和抗原结合等分子功能有关。KEGG分析显示DEG参与肿瘤坏死因子(TNF)、Wnt、白细胞介素(IL)-17和核因子(NF)-κB等信号通路。PPI网络提示CD8A、IL2RG、STAT1、CD3G和SYK是肺缺血-再灌注损伤的核心基因。ceRNA网络提示miR-146a-3p、miR-28-5p和miR-593-3p与CD3G的表达相关;miR-149-3p、miR-342-5p、miR-873-5p和miR-491-5p与IL2RG表达相关;miR-194-3p、miR-512-3p、miR-377-3p和miR-590-3p与SYK表达相关;miR-590-3p和miR-875-3p与CD8A表达相关;miR-143-5p、miR-1231、miR-590-3p、miR-875-3p与STAT1表达相关。CD3G有13种靶向药物,IL2RG有4种靶向药物,SYK有28种靶向药物,lncRNA MUC2有3种靶向药物,未发现CD8A、STAT1和其他ceRNA网络基因的靶向药物。结论CD8A、IL2RG、STAT1、CD3G和SYK是肺缺血-再灌注损伤的核心基因,对核心基因进行研究分析可能有助于肺缺血-再灌注损伤的诊断,并提供新的研究思路和治疗靶点。
李晓凤唐明政刘禧禧宋子晴张国欣杨开银张凌云
关键词:缺血-再灌注损伤核心基因
西瓜真核翻译起始因子4E家族基因介导的隐性抗病机制
马铃薯Y病毒属(Potyvirus)是最大的植物RNA病毒属,该属病毒可以侵染多种粮食作物和经济作物,严重影响作物产量和品质,造成重大经济损失。病毒侵染所依赖的植物基因称为易感基因,易感基因的突变可以赋予寄主对病毒的隐性...
周令希
基因介导的精准免疫疗法在急性髓系白血病治疗中的进展
2024年
急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)是一种骨髓内造血干细胞的克隆异常,进而导致大量异常分化的髓系细胞在骨髓内聚集而产生的疾病。传统的治疗手段难以治愈AML,嵌合抗原受体T细胞(chimeric antigen receptor Tcell,CAR-T)免疫疗法的成功应用预示着血液肿瘤的治疗进入精准免疫疗法新阶段。然而CAR-T免疫疗法在临床应用中存在诸多问题,例如治疗周期长、价格高昂、产生脱靶效应、发生细胞因子释放综合征等,因此,需要扩展嵌合抗原受体的应用或提出改进措施来提升治疗效果。本文综述了CAR免疫细胞基因工程化改造新策略、原位编辑产生CAR-T的研究进展与应用,同时对体内递送基因药物的新方法进行了简要介绍,旨在为扩展和改进精准免疫疗法在AML中的应用提供新思路和理论依据。
赵鹏博朱滢尹莉芳辛晓斐
小立碗藓PpFLS2L基因介导类细胞程序性死亡的研究
维管束植物FLS2(Flagllin sensitive 2)是富含亮氨酸重复序列的类受体蛋白激酶(Leucine-rich repeats RLK,LRR-RLK)家族中最早发现具有抗病功能的蛋白,通过其胞外的LRR结...
何心洁
关键词:小立碗藓几丁质MAPK
细胞色素P450和羧酸酯酶基因介导斜纹夜蛾对异源物质耐受功能研究
斜纹夜蛾(Spodoptera litura Fabricius)属鳞翅目夜蛾科杂食性昆虫,为害300多种植物,目前田间主要利用杀虫剂防治。由于不合理使用杀虫剂,斜纹夜蛾已对溴氰虫酰胺、氯氰菊酯、阿维菌素等多种杀虫剂产生...
李建一
关键词:斜纹夜蛾细胞色素P450羧酸酯酶转录调控
探讨自噬相关基因介导乳腺癌预后及免疫浸润的潜在机制及干预中药预测
2024年
目的利用生物信息学研究乳腺癌自噬相关分子模式和肿瘤微环境免疫细胞浸润特征,同时预测具有潜在治疗作用的中药。方法从TCGA和GEO数据库下载乳腺癌数据,从UCSC Xena数据库获得乳腺癌拷贝数相关数据。使用R语言和Perl分析乳腺癌自噬相关基因在肿瘤组织和癌旁组织表达以及自噬相关基因的拷贝数情况。通过单因素Cox分析、Kaplan-Meier生存分析、最小绝对收缩和选择算子(logistic least absolute shrinkage and selection operator,Lasso)分析、受试者工作特征(receiver operator characteristic,ROC)、列线图构建自噬相关预后模型并评估其预后价值。利用基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)、京都百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、单样本基因集富集分析(single-sample gene set enrichment analysis,ssGSEA)和CIBERSORT算法,探索其在乳腺癌中的潜在生物学功能和免疫细胞浸润情况。在此基础上,将关键基因导入SymMap数据库获取相关中药,采用Cytocaspe构建“中药-成分-靶点”网络图,并通过体外实验验证代表性自噬相关中药对乳腺癌细胞增殖及侵袭的影响。结果大部分自噬相关基因在乳腺癌肿瘤组织和癌旁组织中有表达差异和拷贝数变异,其中肿瘤蛋白P53(tumor protein P53,TP53)的突变频率最高。构建的自噬相关预后模型提示高风险乳腺癌患者预后更差。通过ssGSEA、ESTIMATE和CIBERSORT进一步表明,所建立的模型可能对免疫细胞丰度、免疫细胞类型等产生影响。此外,预测结果提示调控乳腺癌自噬的中药功效以清热解毒、活血化瘀、补阳类为主,药性以辛、苦、甘、寒为主,主要归肝、肺、胃经。实验验证进一步表明,清热解毒药白花蛇舌草、活血化瘀药郁金、补阳药肉苁蓉/淫羊藿可通过调控自噬活性抑制乳腺癌发展。结论自噬指示乳腺癌不良预后,并与肿瘤免疫浸润密切相关。调控乳腺
钟悦王志宇杨博文王能
关键词:乳腺癌预后肿瘤微环境白花蛇舌草郁金肉苁蓉
移动性多黏菌素耐药基因介导的大肠埃希菌药敏特点与同源性分析
2024年
目的分析多黏菌素耐药大肠埃希菌的耐药机制、药敏特点及其同源性,为有效预防和控制其暴发及流行提供分子流行病学依据。方法收集2016年5月至2022年6月分离自临床的多黏菌素耐药大肠埃希菌,应用PCR技术筛选移动性多黏菌素耐药基因(mobile colistin resistance,MCR),采用微量肉汤稀释法测定最小抑菌浓度。收集患者的临床资料,利用脉冲场电泳技术(PFGE)对收集到的菌株进行同源性分析并对其中1株进行全基因组测序分析。结果分离并鉴定出4株携带有MCR-1基因的多黏菌素耐药大肠埃希菌,4株菌株除了对替加环素均敏感外,对于临床常见的绝大多数抗生素均表现出不同程度的耐药。临床资料分析均未发现患者有多黏菌素使用史。该4株菌可分为2种类型,其中A型3株,B型1株。对其中1株菌进行全基因组测序分析发现MCR-1基因位于约70 kb的质粒上。结论携带MCR-1基因的多黏菌素耐药大肠埃希菌具有克隆传播的潜在威胁,对临床常见抗生素均表现出较高的耐药性,为临床治疗带来极为严重的挑战,需要加强防护措施,防止其暴发流行。
赵树龙宋爽刘乐许晶晶徐银海康海全
关键词:大肠埃希菌脉冲场电泳耐药同源性分析
MiR-221-5p负调控MUC5B基因介导EMT在肺纤维化形成中的作用及机制研究
研究背景与目的:特发性肺纤维化(Idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)是一种进行性纤维化肺病,影响着全球500万人,中位生存期为3-5年[1],为间质性肺疾病中预后最差的分型之一。IPF发病...
丁东延
关键词:肺纤维化

相关作者

李圆
作品数:12被引量:9H指数:2
供职机构:重庆医科大学附属儿童医院
研究主题:荷瘤小鼠 基因介导 多药耐药基因 骨髓移植 骨髓保护
郭泽建
作品数:82被引量:626H指数:16
供职机构:中国农业大学
研究主题:水稻 WRKY基因 防卫反应 转基因水稻 铁蛋白
杨亚珍
作品数:21被引量:48H指数:4
供职机构:浙江中医药大学
研究主题:肾小管上皮细胞 大黄素 基因介导 TOLL样受体4 IGA肾病
熊立仲
作品数:166被引量:282H指数:6
供职机构:华中农业大学
研究主题:水稻 抗旱性 基因 表型鉴定 转基因水稻
姜平
作品数:474被引量:1,908H指数:22
供职机构:南京农业大学
研究主题:猪繁殖与呼吸综合征病毒 PRRSV 单克隆抗体 猪圆环病毒2型 猪繁殖与呼吸综合征