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鹅星状病毒与新型鸭呼肠孤病毒双重RT-PCR检测方法的建立及应用
2024年
根据鹅星状病毒(GAstV)ORF1b基因与鹅源新型鸭呼肠孤病毒(NDRV)σC基因的保守序列设计特异性引物,建立GAstV与NDRV双重RT-PCR检测方法,该方法具有较高的特异性,在903 bp(GAstV)和226 bp(NDRV)可检测到特异性条带,最低灵敏度为1.0×10^(3)copies/μL。在鲁中、鲁西北及鲁南地区不同规模的养鹅场中随机采取320份样本,GAstV的阳性率为21.56%(69/320),NDRV的阳性率为3.44%(11/320),混合感染阳性率为2.81%(9/320),单一RT-PCR结果与双重RT-PCR方法一致。该方法的建立为快速诊断GAstV和NDRV提供了可靠的手段。
张景辉武景琦房立春刘涛吴家强于可响徐怀英吕俊峰艾武郭慧君邱建华亓丽红宋玲玲
关键词:双重RT-PCR
禽流感病毒H10N3亚型一步法双重RT-PCR检测方法的建立被引量:1
2023年
2021年6月初,我国报道了全球首例H10N3亚型禽流感病毒感染人的事件,该亚型病毒具有跨宿主感染人类的能力,对社会公共卫生安全形成潜在的重大危害,因此,亟须建立一种快速、简便、适用于实验室的H10N3亚型禽流感病毒核酸检测方法。将自GISAID下载的H10N3亚型禽流感病毒HA基因和NA基因序列进行分析比对后,根据其保守区域设计并筛选出2对特异性检测引物,分别对引物浓度、核酸浓度、退火温度、循环数等进行优化,以确定最佳反应条件,建立禽流感病毒H10N3亚型一步法双重RT-PCR检测方法。结果显示,该方法可分别扩增出407 bp和602 bp禽流感病毒H10基因和N3基因的特异性条带,且不与H1N1、H3N2、H6N6、H7N9、H9N2亚型禽流感病毒以及NDV、IBV、IBDV、DTMUV发生交叉反应。该方法灵敏度高,最低检出限为900 pg。在对36份已知的临床样品的检测中,H10N3亚型禽流感病毒阳性率为2.78%,与禽流感H10Nx基因型、Hx N3基因型一步法RT-PCR检测方法以及病毒分离鉴定结果一致,符合率均为100%。上述结果表明,本研究建立的一步法双重RT-PCR方法可以在一次PCR反应中检出H10与N3亚型禽流感病毒混合感染或者单一感染样品,为兽医工作者开展H10N3、H10Nx和Hx N3亚型禽流感的临床诊断和流行病学监测提供了一种简单、有效的分子生物学快速检测方法。
杨芷翊王新凯柳洋付思源张钰炘史玉婷曹琛福贾伟新
关键词:禽流感病毒双重RT-PCR
鸭甲肝病毒1型和3型一步法双重RT-PCR鉴别检测方法的建立及其初步应用
2023年
为建立一种快速鉴别不同基因型鸭甲肝病毒(DHAV)的检测方法,根据DHAV-1和DHAV-3特异性序列,分别设计合成鉴别检测引物,经一步法双重RT-PCR反应条件的优化,建立了鉴别DHAV-1和DHAV-3的一步法双重RT-PCR方法,并应用该方法对2016—2021年山东地区采集的58份临床病料样品进行病原学检测分析。结果显示:该方法能够分别扩增出DHAV-1的230 bp和DHAV-3的502 bp的特异性条带,而DTMUV、NDV、AIV-H9、FADV、DEV、GPV均无任何扩增条带。该方法最低可检测到0.62 ng DHAV-1 RNA和0.59 ng DHAV-3 RNA。该方法与病毒分离方法的符合率达100%。该方法检测58份临床病料样品,共检测出阳性样品27份,阳性率达46.55%,其中2016—2021年DHAV-1阳性率分别为33.33%,25.00%,22.22%,12.50%,11.11%,0.00%;DHAV-3阳性率分别为8.33%,16.67%,22.22%,37.50%,33.33%,37.50%。表明建立的DHAV-1和DHAV-3一步法双重RT-PCR鉴别检测方法具有良好的特异性、敏感性、准确性和临床适用性;同时发现山东地区DAHV的优势流行毒株已由DHAV-1转变为DHAV-3。
祖立闯李娇苗立中郭璐王艳萍王文秀
关键词:病原学流行毒株
贝类中沙门氏菌、阪崎肠杆菌双重RT-PCR检测方法研究
2023年
旨在建立一种快速、高效、经济、实用的双重实时荧光PCR方法,能同时快速、灵敏、特异地检测贝类中沙门氏菌、阪崎肠杆菌的双重实时荧光PCR体系。本研究以水产品中贝类为目标,根据特定基因序列,设计特异性扩增引物和TaqMan荧光探针,通过优化反应体系和条件,每种引物探针体系均可以特异性检测目标致病菌类型。2套引物探针体系组合可同时检测沙门氏菌、阪崎肠杆菌。双重RT-PCR方法的最低检测限可低至0.002 ng或0.02 ng基因组/反应,变异系数均小于2%。利用建立的双重RT-PCR方法检测14份贝类产品样本,样品实测结果与国家标准方法的检测结果一致,符合率为100%。结果表明,本研究建立的双重RT-PCR方法具有特异性、敏感性高、重复性好等优点,为贝类产品中沙门氏菌、阪崎肠杆菌的快速检测提供了新的技术方法。
田立杰聂丹丹丁旭闫聪李玲孙玉罗雁非
关键词:贝类沙门氏菌阪崎肠杆菌
一种冻干型甲型和乙型流感病毒的双重RT-PCR检测试剂盒
本发明提供一种冻干型甲型和乙型流感病毒的双重RTPCR检测试剂盒,包括以下组分:RTPCR缓冲液、冻干缓冲液、DNA聚合酶、RNase抑制剂、甲型流感病毒RTPCR的引物和探针、乙型流感病毒RTPCR的引物和探针...
洪阅滨史宣莲陈学伟卓明辉张成彭成彬王香玲
一种同时检测罗湖病毒和病毒性神经坏死病毒的双重RT-PCR的引物组,试剂盒和方法
本发明公开了一种同时检测罗湖病毒和病毒性神经坏死病毒的双重RTPCR的引物组,试剂盒和方法。所述引物组序列如SEQ ID NO:1和2,SEQ ID NO:3和4所示。运用该引物组可以同时检测两种病毒,缩短时间,加快检...
徐淑菲曾韵颖孔凡德刘启霖林双庆朱黄鑫陈信忠方成俊
猪繁殖与呼吸综合征病毒经典株和高致病株双重RT-PCR检测方法的建立
2022年
【目的】建立具有高敏感性能区分猪繁殖与呼吸综合征病毒经典株和高致病株的双重RT-PCR检测方法。【方法】首先从退火温度与引物浓度先对猪繁殖与呼吸综合征病毒经典株、高致病株的单项RT-PCR方法的条件分别进行筛选与优化,然后对其双重RT-PCR方法的条件进行筛选与优化,并进行特异性与敏感性检测,最后初步应用于临床样品检测。【结果】建立的猪繁殖与呼吸综合征病毒经典株和高致病株双重RT-PCR检测方法不能检出猪流行性腹泻病毒和猪瘟病毒等当前流行较广的其他猪源RNA病毒,对猪繁殖与呼吸综合征病毒经典株、高致病株的检测灵敏度分别是100、200 copies/μL。此方法对2020—2021年8个猪场的220份血清样品的检测结果显示,猪繁殖与呼吸综合征病毒经典株、高致病株的个体阳性率分别为7.73%和43.64%,与单项RT-PCR方法检测结果完全一致。【结论】建立了一种高敏感性的猪繁殖与呼吸综合征病毒经典株和高致病株双重RT-PCR检测方法。
赵刘洋李涵乔芮雪段燕方贺晓霜周双海
关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒双重RT-PCR
2种鹅星状病毒一步法双重RT-PCR检测方法的建立与应用被引量:1
2022年
为建立能同时快速鉴别新型鹅星状病毒和鹅星状病毒变异株的检测方法,根据新型鹅星状病毒的ORF2基因和鹅星状病毒变异株的ORF1a基因的保守区域序列,设计并合成2对特异性引物。通过优化反应体系及反应条件,建立了能同时检测2种鹅星状病毒的一步法双重RT-PCR检测方法。该方法可同时扩增出新型鹅星状病毒658 bp和鹅星状病毒变异株381 bp的特异性条带,对坦布苏病毒、鹅细小病毒、鹅副黏病毒、H9N2亚型禽流感病毒、大肠杆菌和沙门菌的扩增结果均为阴性,具有良好的特异性。对新型鹅星状病毒和鹅星状病毒变异株重组质粒的最低检测量分别是1μl 1.71×103拷贝和1μl 1.70×103拷贝,敏感性良好,并且具有良好的重复性。应用该方法对临床采集的雏鹅泄殖腔拭子进行检测,结果显示,124份样品中新型鹅星状病毒阳性率为45.16%,鹅星状病毒变异株阳性率为28.23%,2种鹅星状病毒均为阳性的占11.29%,与单一RT-PCR方法检测结果符合率为100.00%。本研究建立的一步法双重RT-PCR检测方法快速简便,特异性强、灵敏度高,可用于临床样品的鉴别诊断,该方法的建立对2种鹅星状病毒病的流行病学调查和有效防控以及混合感染的致病性研究具有重要意义。
杨颖肖亦辰马平赵冬敏章丽娇李银李银杨婧刘青涛韩凯凯杨婧
鹅星状病毒与新型鸭呼肠孤病毒双重RT-PCR检测方法的建立及应用
2020年我国肉鹅出栏量在5亿只左右,作为鹅养殖业大省,山东省肉鹅出栏量在6720万只左右,随着养鹅业的蓬勃发展,规模化和集约化的养殖导致疫病发生越来越多,自2017年以来,我国部分地区开始陆续出现鹅星状病毒和新型鸭呼肠...
张景辉
关键词:双重RT-PCR
鸭丙型肝炎病毒和鸭新型微核糖核酸病毒双重RT-PCR检测引物
本发明涉及一种鸭丙型肝炎病毒和鸭新型微核糖核酸病毒双重RTPCR检测引物,所述引物如下:针对鸭丙型肝炎病毒的特异性引物序列如SEQ.ID.No.1、SEQ.ID.No.2所示,目的片段大小为502bp;针对鸭新型微核糖...
陈翠腾刘斌琼陈珍朱春华蔡国漳
文献传递

相关作者

徐志文
作品数:396被引量:1,108H指数:14
供职机构:四川农业大学
研究主题:猪细小病毒 伪狂犬病病毒 病毒 伪狂犬病 伪狂犬病毒
朱玲
作品数:317被引量:817H指数:13
供职机构:四川农业大学
研究主题:病毒 猪细小病毒 VP2基因 伪狂犬病病毒 ORF2基因
刘金华
作品数:246被引量:380H指数:11
供职机构:中国农业大学
研究主题:禽流感病毒 流感病毒 禽流感 引物 H3N8
蒲娟
作品数:107被引量:47H指数:4
供职机构:中国农业大学
研究主题:禽流感病毒 流感病毒 引物 标记基因 原核
谢金文
作品数:161被引量:427H指数:10
供职机构:山东省滨州畜牧兽医研究院
研究主题:猪瘟病毒 猪瘟 猪繁殖与呼吸综合征病毒 原核表达 CSFV