搜索到29464篇“ 代谢组学“的相关文章
- 代谢组学
- 代谢组学是近年来刚刚发展起来的一门技术,与基因组学、蛋白组学不同,代谢组学研究的是单细胞或复杂生物体系如体液中的分子量1000以下的小分子,涉及到生物、化学和数学等学科。本书分两部分。第一部分共三章,较为系统地介绍了代谢...
- 许国旺编著
- 关键词:代谢
- 一种基于卷积神经网络的核磁共振波谱代谢组学分析方法
- 本发明公开了一种基于卷积神经网络的核磁共振波谱代谢组学分析方法,涉及代谢组学技术领域,其技术方案要点是:获取生物样本的核磁共振氢谱代谢数据并进行预处理;将预处理后的数据进行特征构建;构建基于卷积神经网络的深度学习模型并进...
- 王卓琦申传安
- 一种基于蛋白质组学和代谢组学的活动性肺结核诊断方法
- 本发明公开了一种基于蛋白质组学和代谢组学的活动性肺结核诊断方法,包括以下步骤:收集疑似活动性肺结核患者的血清样本;使用蛋白质组学技术,检测血清样本中的特定蛋白质;使用代谢组学技术,检测血清样本中的特定氨基酸;将获得的蛋白...
- 唐骏张舒林
- 一种基于代谢组学鉴别滑皮金柑和脆蜜金柑品种的方法及应用
- 本发明公开了一种基于代谢组学鉴别滑皮金柑与脆蜜金柑品种的方法及应用,首次将代谢组学技术手段运用于金柑新品种脆蜜金柑与传统品种滑皮金柑的鉴别,最大限度地检测金柑内源性代谢产物,避免了传统分析手段的片面性,提高了结果的准确性...
- 罗朝丹黎新荣冯春梅李建强刘功德王淋靓郝小玲檀业维姜宗伯庞春秀刘帅民赖园园岑继维石保纬
- 细胞转录组学和代谢组学整合策略表征突变影响谷氨酰胺合成酶酶活的关键代谢通路
- 2025年
- 谷氨酰胺合成酶(GS)是细胞中唯一可以从头合成谷氨酰胺的酶,在癌症代谢中扮演着重要角色。GS酶活缺陷突变往往导致严重的代谢疾病甚至是死亡。理解GS酶活降低对生理功能的影响可能为靶向治疗提供新的方向,同时对其内在机制的探索可以为治疗干预开辟新的途径。已报道的GS酶活缺陷突变包括R324C(第324位精氨酸突变为半胱氨酸)和R341C(第341位精氨酸突变为半胱氨酸)等,本研究新发现了GS的另一个酶活缺陷突变位点K241(第241位赖氨酸)。为了探究GS酶活缺陷突变带来的影响,本研究利用双组学技术对GS的酶活缺陷突变R324C和K241R(第241位赖氨酸突变为精氨酸)在肺癌细胞中的功能进行研究,通过对转录组和代谢组数据的整合揭示了GS酶活缺陷突变对一些重要生物过程的显著影响。GS的缺陷突变阻碍了细胞周期和多种氨基酸代谢途径。除了谷氨酰胺合成受到抑制,精氨酸-脯氨酸代谢、甘氨酸-丝氨酸-酪氨酸代谢以及天冬氨酸-谷氨酸-丙氨酸代谢在GS突变的细胞中表现出更强的活力,同时,氨酰-tRNA的生物合成途径也显著被激活。进一步的研究发现,GS酶活缺陷带来氨基酸代谢的改变源自谷氨酸的重新定向和相关代谢酶的表达变化,同时,氨酰-tRNA生物合成的激活源自谷氨酰胺在GS酶活缺陷细胞中带来的能量应激激活了特定蛋白的表达,如转录因子4(ATF4)。此外,细胞表型实验表明,GS酶活缺陷细胞的迁移能力低于野生型细胞。以上结果揭示了GS酶活缺陷突变体细胞中的代谢重编程现象,突出了癌细胞代谢的复杂性和适应性。
- 凌婷石京冯婷泽裴劭君李思怿朴海龙
- 关键词:转录组学代谢组学谷氨酰胺
- 基于代谢组学特征分析的胃癌复发风险预测方法
- 本发明公开了一种基于代谢组学特征分析的胃癌复发风险预测方法,S1、构建代谢组学数据集;S2、对采集的代谢组学数据集进行预处理;S3、提取与胃癌复发相关的代谢物特征;S4、基于提取的代谢物特征,利用代谢途径积分法对每条代谢...
- 马佩王强龚颖芸方圆
- 基于非靶向代谢组学的绿豆芽代谢物差异分析
- 2025年
- 为了比较不同品种绿豆芽的代谢物差异,利用非靶向代谢组学分析方法对晋绿豆2号豆芽和滩绿116豆芽的代谢物进行分析。结果表明,从2种豆芽中共检测出1 968种差异代谢物。根据重要性投影值(VIP)≥1和P<0.05的标准,共筛选得到差异显著的代谢物1 064种,占总差异代谢物的54.07%。这1 064种差异代谢物主要分布在丙烷、哌啶和吡啶类生物碱生物合成通路,氨基糖和核苷酸糖代谢通路、膦酸盐和次膦酸盐代谢通路,萜类主干生物合成通路,糖酵解/糖异生通路中。差异代谢物中,葫芦巴碱具有降血糖的作用,其代谢途径为烟酸和烟酰胺代谢途径,该代谢途径属于丙烷、哌啶和吡啶类生物碱生物合成通路,滩绿116豆芽中葫芦巴碱含量显著高于晋绿豆2号豆芽。本研究结果为绿豆芽用种质资源挖掘提供了理论依据。
- 王新妤张鸣慧姚玲张丁张振鑫申慧芳郭锋
- 关键词:绿豆芽代谢途径
- 基于代谢组学研究柴胡皂苷C对急性肝损伤小鼠的保护作用
- 2025年
- 目的基于血清代谢组学研究柴胡皂苷C(SSC)对四氯化碳(CCl4)诱导的急性肝损伤(ALI)小鼠的保护作用及机制。方法将40只小鼠按随机数字表法分为空白组(水)、模型组(水)、阳性对照药组(联苯双酯滴丸,150 mg/kg)和SSC低、高剂量组(2.5、10 mg/kg),每组8只,每天灌胃水/药物1次,连续7 d。末次给药1 h后,除空白组外的其余各组小鼠均腹腔注射0.2%CCl4橄榄油溶液以建立ALI模型。造模17 h后,计算小鼠肝指数,检测小鼠血清中天冬氨酸转氨酶(AST)、丙氨酸转氨酶(ALT)、乳酸脱氢酶(LDH)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素6(IL-6)、IL-1β水平,观察小鼠肝组织病理学变化,并采用液质联用法对小鼠血清进行代谢组学分析。结果与空白组比较,模型组小鼠肝指数和ALT、AST、LDH、TNF-α、IL-6、IL-1β水平均显著升高(P<0.01);肝细胞出现水肿、空泡变性并有较多坏死,可见炎症细胞大量浸润。与模型组比较,SSC高剂量组小鼠肝指数和血清指标水平均显著降低(P<0.05或P<0.01),且肝组织病理学损伤明显改善。代谢组学研究结果显示,与模型组比较,SSC高剂量组小鼠血清中上调的差异代谢物有63个、下调的有256个(包括前列腺素B2、20-羟基白三烯B4、5-羟色氨酸、7α-羟基胆固醇等代谢物),主要涉及花生四烯酸代谢、5-羟色胺突触、初级胆汁酸生物合成等代谢途径。结论高剂量SSC可通过下调前列腺素B2、20-羟基白三烯B4等关键代谢物水平,减少花生四烯酸代谢、5-羟色胺突触、初级胆汁酸生物合成等代谢途径,进而对CCl4诱导的ALI小鼠发挥保护作用。
- 李新存彭东辉王永福施亚敏吴梦娟付智慧王娟
- 关键词:急性肝损伤代谢组学花生四烯酸代谢
- 基于深度学习和非靶向代谢组学的代谢反应对预测方法
- 本发明公开一种基于深度学习和非靶向代谢组学的代谢反应对预测方法,属于生物信息学技术领域,包括步骤:(1)将反应物和产物组成代谢物反应对,并将其转换为分子指纹对,从而构建出代谢反应对数据集;(2)建立输入为分子指纹,输出为...
- 许国旺包涵路鑫王鑫欣赵春霞赵欣捷
- 基于非靶向代谢组学的红景天和麦冬代谢途径及代谢产物差异分析
- 2025年
- 为研究麦冬和红景天代谢产物的多样性和相关性,采用液相色谱-高分辨质谱技术分析麦冬、红景天以及麦冬和红景天复合提取物代谢产物,对物质种类及其含量进行分类、主成分分析(principal component analysis,PCA)、最小偏二乘判别分析(partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)以及代谢途径分析。研究发现,红景天和麦冬代谢产物以酮醛酸、醇酚类和黄酮类等为主,红景天中具有较为丰富的苷类化合物,而麦冬中糖类成分种类较多。红景天、麦冬及其复合提取物的代谢产物组成具有明显差异,使用富集分析确定红景天和麦冬的共有代谢途径为核黄素代谢、花生四烯酸代谢、类固醇类激素合成代谢、淀粉和蔗糖代谢、果糖和甘露糖代谢和α-亚麻酸代谢,该共有代谢途径是根茎类药材中抗氧化、抗炎、滋阴、提升免疫力等功能性小分子化合物形成的关键途径。D-吡喃半乳糖是麦冬多糖代谢通路的重要中间体,是麦冬多糖形成的关键。红景天和麦冬在配伍过程中酯类、醇酚类及羧酸等成分是影响其活性的关键物质。
- 于然金丽华李敬慈王子豪
- 关键词:麦冬红景天
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- 许国旺

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